インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%

brew install nanoq

local Homebrew formula metadata

概要

パッケージ概要

Minimal but speedy quality control and summaries of nanopore reads

プロジェクトリンク

コマンドとエイリアス

nanoq

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

Nanoq is a Rust command-line utility for rapid filtering, trimming, quality control, and summary reporting of Oxford Nanopore FASTA/FASTQ reads. It is designed to work with files or Unix streams and emphasizes low memory use and high throughput.

プロジェクトの歴史

The public repository and first tagged releases appeared in March 2020. The project subsequently expanded its filters, reports, compression support, and machine-readable output, reaching the 0.8 series in 2021, 0.9.0 in 2022, and 0.10.0 in 2023. Steinig and Coin described Nanoq in the Journal of Open Source Software in 2022.

採用の歴史

Nanoq is distributed through Cargo, Conda/Bioconda, precompiled Linux and macOS release archives, and a Homebrew formula. Its official benchmarks position it alongside established sequencing utilities including NanoFilt, NanoStat, Filtlong, seqtk, SeqKit, and rust-bio-tools.

使われ方

Users pass FASTA or FASTQ reads by file or standard input, apply length or quality filters and optional end trimming, and send surviving reads to a file or standard output. Statistics can be emitted as compact text, verbose summaries, or JSON; a fast mode skips quality-score calculation for greater throughput.

パッケージ好きにとっての重要性

Nanoq is notable as a small, single-purpose Rust CLI that composes naturally in Unix pipelines while being packaged across the Rust, bioinformatics, binary-release, and Homebrew ecosystems. Its benchmarked trade-off between full quality calculations and an exceptionally fast quality-free mode makes it useful when choosing lightweight tools for large sequencing streams.

タイムライン

2020: First public tagged releases.
2021: The 0.8 release series broadened the mature CLI.
2022: Nanoq was published in the Journal of Open Source Software and version 0.9.0 was released.
2023: Version 0.10.0 was released.

Related projects

NanoFilt and NanoStat provide nanopore filtering and statistics workflows used as official benchmark comparisons.
Filtlong, seqtk, SeqKit, and rust-bio-tools are neighboring read-processing tools compared in Nanoq's official benchmarks.
Needletail and niffler provide Nanoq's read-processing and compression foundations.

ソース

https://github.com/esteinig/nanoq
https://github.com/esteinig/nanoq/releases
https://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.02991
source_facts.package-manager.brew

セキュリティ状態

保護ツール対応はまだ見つかっていません

nanoq に一致するローカルシークレット処理マニフェストは見つかりませんでした。将来の対応で安定したパッケージ URL を使えるよう、パッケージメタデータはここに公開されています。

インストール挙動

formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
Homebrew bottle メタデータは 6 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
ビルドメタデータには 1 件のビルド依存関係があります。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド	種類	公開範囲	メモ
`nanoq`	cli	グローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-08-04

マネージャ版0.10.0

マネージャ更新日2026-07-14

ローカルデータOK

上流最新

検出された最新0.10.0

https://github.com/esteinig/nanoq

OK鮮度警告は生成されていません。

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキー	brew:nanoq
バージョン	0.10.0
パッケージマネージャ	Homebrew
パッケージマネージャページ	https://formulae.brew.sh/formula/nanoq
ホームページ	https://github.com/esteinig/nanoq
リポジトリ	https://github.com/esteinig/nanoq
ライセンス	MIT
ソースアーカイブ	https://github.com/esteinig/nanoq/archive/refs/tags/0.10.0.tar.gz
最終更新	2026-07-14T06:59:42Z
Pulse	updated
ビルド依存関係	rust
Bottle	利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install	未定義
サービス	宣言なし

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	nanoq
Version Scheme	0
Revision	0
Head Version	HEAD
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	head stable

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/nanoq.yml

使用ソース

cross-ecosystem install command graph
curated package history
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment
pkg.so package database
pkgdb category and tag curation

nanoq を Homebrew でインストール