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brew / 順位 9805

rasusa を Homebrew でインストール

rasusa のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。

インストールコマンドセキュリティノート

インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%
brew install rasusa

local Homebrew formula metadata

概要

パッケージ概要

Randomly subsample sequencing reads or alignments

コマンドとエイリアス

  • rasusa

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

Rasusa is a Rust command-line program for randomly downsampling sequencing reads or genome alignments, including targeting a requested sequencing coverage.

プロジェクトの歴史

Rasusa was created to randomly subsample sequencing reads to a requested coverage. Its methods and purpose were documented in a 2022 Journal of Open Source Software paper. The project subsequently expanded beyond FASTQ reads to support unaligned and aligned SAM, BAM, and CRAM workflows, with alignment downsampling documented in a 2026 Gigabyte paper.

採用の歴史

Rasusa is available through precompiled release binaries, Cargo and cargo-binstall, Bioconda, containers, and Homebrew. The official README documents the shift of container distribution from Docker Hub to Quay.io and later to GitHub Container Registry.

使われ方

For reads, users supply FASTQ or unaligned SAM/BAM/CRAM input and request a coverage or other sampling target; results are written to standard output unless otherwise directed. Current releases also provide alignment-oriented downsampling. The CLI supports paired sequencing data and integrates readily into shell and bioinformatics pipelines.

パッケージ好きにとっての重要性

Rasusa packages a common bioinformatics preprocessing task into a fast, reproducible Rust executable with few operational complications. Its presence across Cargo, Bioconda, containers, and Homebrew illustrates how research software can bridge language-native, scientific-workflow, and general-purpose package ecosystems.

タイムライン

  • 2022: Rasusa was described in the Journal of Open Source Software.
  • Before 0.4.0: Official containers were hosted on Docker Hub.
  • 0.4.0–2.2.0: Official containers were hosted on Quay.io.
  • 2026: Efficient genome-alignment downsampling with Rasusa was described in Gigabyte.

Related projects

  • Cargo and cargo-binstall distribute the Rust executable.
  • Bioconda integrates Rasusa into bioinformatics package and workflow environments.
  • SAM, BAM, CRAM, and FASTQ are the principal sequencing formats handled by the tool.

セキュリティ状態

リスクレベル: グリーン

narrow executable package without higher-risk signals.

リスク分類器

リスク グリーン · 信頼度 低 · appliance

理由

  • narrow executable package without higher-risk signals

信号

  • metadata:no-higher-risk-signals

インストール挙動

  • formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
  • Homebrew bottle メタデータは 6 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
  • ビルドメタデータには 1 件のビルド依存関係があります。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド種類公開範囲メモ
rasusacliグローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-09-19
マネージャ版5.1.0
マネージャ更新日2026-09-13
ローカルデータOK
上流最新
検出された最新5.1.0

https://github.com/mbhall88/rasusa

  • OK鮮度警告は生成されていません。

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキーbrew:rasusa
バージョン5.1.0
パッケージマネージャHomebrew
パッケージマネージャページhttps://formulae.brew.sh/formula/rasusa
ホームページhttps://doi.org/10.21105/joss.03941
リポジトリhttps://github.com/mbhall88/rasusa
上流ドキュメントhttps://doi.org/10.21105/joss.03941
ライセンスMIT
ソースアーカイブhttps://github.com/mbhall88/rasusa/archive/refs/tags/5.1.0.tar.gz
最終更新2026-09-13T07:18:51Z
Pulseupdated
ビルド依存関係rust
Bottle利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install未定義
サービス宣言なし

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Namerasusa
Version Scheme0
Revision0
Head VersionHEAD
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • head
  • stable

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

関連ツール

  • rustBuild dependency declared by Homebrew.

同じワークフロー

  • fastpShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, fastq, science, sequencing.
  • trim-galoreShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, fastq, science, sequencing.
  • fastq-toolsShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, fastq, science, sequencing.
  • badreadShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, science, sequencing.
  • fastqcShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, fastq, science, sequencing.
  • adapterremovalShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, fastq, science, sequencing.

エージェント安全ガイド

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

使用ソース

  • Geiger risk classifier
  • cross-ecosystem install command graph
  • curated package history
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment
  • pkg.so package database
  • pkgdb category and tag curation