macOS
Homebrewvérifié · 100%
brew install pymollocal Homebrew formula metadata
MacPortsvérifié · 94%
sudo port install pymolMacPorts ports tree · science/pymol/Portfile · Source: api.github.com
brew / rang 2446
Installer pymol avec Homebrew, apt, dnf, MacPorts, Nix, pacman, winget, zypper
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de pymol pour les workflows d'agents IA.
installation
Commandes d'installation supplémentaires
Linux
Debian aptvérifié · 92%
sudo apt install pymolDebian stable package indexes · pymol · Source: deb.debian.org
Fedora dnfvérifié · 92%
sudo dnf install pymolFedora Rawhide package metadata · pymol · Source: dl.fedoraproject.org
Nixvérifié · 92%
nix profile install nixpkgs#pymolnixpkgs package indexes · pkgs/by-name/py/pymol/package.nix · Source: api.github.com
Arch Linux pacmanvérifié · 92%
sudo pacman -S pymolArch Linux sync databases · pymol · Source: geo.mirror.pkgbuild.com
openSUSE zyppervérifié · 92%
sudo zypper install python313-pymolopenSUSE Tumbleweed package metadata · python313-pymol · Source: download.opensuse.org
Windows
Windows Package Managervérifié · 92%
winget install --id Schrodinger.PyMOL -eWindows Package Manager source index · Schrodinger.PyMOL · Source: cdn.winget.microsoft.com
aperçu
Résumé du paquet
Molecular visualization system
Liens du projet
Commandes et alias
- pymol
historique
Historique du projet et usages
PyMOL is an interactive, scriptable molecular-visualization system with an open-source foundation maintained by Schrödinger.
Historique du projet
PyMOL was created by Warren L. DeLano around an open-source vision for molecular visualization. It grew into a widely used environment for viewing, rendering, animating, scripting, and presenting three-dimensional molecular structures.
Following DeLano's death in 2009, Schrödinger reached an agreement with his estate in 2010 to continue development, support, sales, and stewardship of the open-source community. Schrödinger continues to maintain the open-source foundation alongside supported commercial distributions.
Historique d'adoption
PyMOL developed a broad community across academia, education, biotechnology, and pharmaceutical research. The open-source repository's project history describes a worldwide user community, while the official site characterizes it as a leading tool for customizable biomolecular imagery.
The supplied package facts show distribution across Homebrew, Debian, Fedora-family repositories, MacPorts, Nix, Arch, Ubuntu, openSUSE, and Windows Package Manager, reflecting adoption beyond Schrödinger's commercial bundles.
Modes d'utilisation
Use the graphical interface for interactive molecular inspection or the PyMOL command line and Python API for selections, representations, alignment, rendering, animation, and repeatable workflows.
PyMOL loads `$HOME/.pymolrc` on startup as command-language code, or `$HOME/.pymolrc.py` for Python startup code. Sessions can preserve objects, views, representations, and animations for later presentation or collaboration.
Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent
PyMOL is notable for combining an interactive scientific GUI, a domain-specific command language, Python scripting, publication-quality rendering, and reproducible session files. Its coexistence as open-source code and a commercially supported product is also a distinctive packaging and sustainability model.
Chronologie
- 2009: Creator Warren L. DeLano died unexpectedly.
- 2010: Schrödinger agreed with DeLano's estate to continue PyMOL's development and support.
- Present stewardship: Schrödinger maintains the open-source project alongside commercially supported distributions.
Related projects
- PyMOL's Python API and command language support scripted visualization and automation.
- Schrödinger's supported distribution builds on the same open-source foundation and adds packaging, documentation, and commercial support.
Sources
posture de sécurité
Niveau de risque : vert
narrow executable package without higher-risk signals.
Classificateur de risque
risque vert · confiance faible · appliance
Pourquoi
- narrow executable package without higher-risk signals
Signaux
- metadata:no-higher-risk-signals
Comportement d'installation
- Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
- Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 5 plateformes.
- S’installe avec 7 dépendances d’exécution.
- Les métadonnées de compilation listent 4 dépendances de compilation.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
local files
Configuration and credential file locations
These source-backed paths show where this package keeps local settings or durable credentials. Automic Vault can use them as review targets for secret scanning, migration, and command approval.
Configuration files
Config paths the tool may read or write during local use.
- Unix
~/.pymolrc~/.pymolrc.py
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
pymol | cli | exécutable global |
fraîcheur
Version et fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
page générée2026-11-04
version du gestionnaire3.1.0
gestionnaire mis à jour2026-10-30
données localesOK
amontà jour
dernière version détectéev3.1.0
https://github.com/schrodinger/pymol-open-source
- OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.
métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:pymol |
|---|---|
| Version | 3.1.0 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page du gestionnaire de paquets | https://formulae.brew.sh/formula/pymol |
| Page d'accueil | https://pymol.org/ |
| Dépôt | https://github.com/schrodinger/pymol-open-source |
| Docs amont | https://pymol.org/ |
| Licence | LicenseRef-Homebrew-cannot-represent |
| Archive source | https://github.com/schrodinger/pymol-open-source/archive/refs/tags/v3.1.0.tar.gz |
| Dernière mise à jour | 2026-10-30T04:21:16Z |
| Pulse | updated |
| Dépendances | freetype, glew, libpng, netcdf, numpy, pyqt, python@3.15 |
| Dépendances de compilation | cmake, glm, msgpack-cxx, python-setuptools |
| Bibliothèques fournies par macOS | libxml2 |
| Bouteille | disponible (sur arm64_golden_gate, arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_tahoe, x86_64_linux) |
| post-install Homebrew | non défini |
| Service | aucun déclaré |
| Précautions | To generate movies, run `brew install ffmpeg`. |
faits du registre
Détails de la base source
| Source Database | Homebrew formula API |
|---|---|
| Tap | homebrew/core |
| Full Name | pymol |
| Version Scheme | 0 |
| Revision | 4 |
| Head Version | HEAD |
| Bottle Stable Root URL | https://ghcr.io/v2/homebrew/core |
| Deprecated | no |
| Disabled | no |
| Keg Only | no |
| URL Keys |
|
correspondances dans les bases sources
Autres enregistrements de gestionnaires de paquets
Les correspondances proviennent d’index externes de gestionnaires de paquets et restent séparées des liens de paquets Automic Vault locaux.
Debian apt95%
pymol 3.1.0+dfsg-1
Molecular Graphics System
sudo apt install pymol- Section: science
- Architecture: all
- 1 Dépendances
- 1 dépendances optionnelles
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
Debian apt95%
pymol-data 3.1.0+dfsg-1
data files for PyMOL
sudo apt install pymol-data- Section: science
- Architecture: all
- Source Package: pymol
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
Debian apt95%
python3-pymol 3.1.0+dfsg-1
Molecular Graphics System (Python 3 modules)
sudo apt install python3-pymol- Section: python
- Architecture: amd64
- Source Package: pymol
- 19 Dépendances
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
Nix95%
pymol
nix profile install nixpkgs#pymol- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
Ubuntu apt95%
pymol 2.5.0+dfsg-1build6
Molecular Graphics System
sudo apt install pymol- Section: universe/science
- Architecture: all
- 1 Dépendances
- 1 dépendances optionnelles
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
Ubuntu apt95%
pymol-data 2.5.0+dfsg-1build6
data files for PyMOL
sudo apt install pymol-data- Section: universe/science
- Architecture: all
- Source Package: pymol
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
Ubuntu apt95%
python3-pymol 2.5.0+dfsg-1build6
Molecular Graphics System (Python 3 modules)
sudo apt install python3-pymol- Section: universe/python
- Architecture: amd64
- Source Package: pymol
- 17 Dépendances
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
dnf95%
pymol 3.1.0-17.fc45
PyMOL Molecular Graphics System
sudo dnf install pymol- License: MIT-0 AND BSD-2-Clause AND BSD-3-Clause AND Bitstream-Vera AND OFL-1.1
- Category: Unspecified
- Architecture: x86_64
- Source Package: pymol
- 16 Dépendances
- 9 fournit
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
dnf95%
pymol+tests 3.1.0-17.fc45
Metapackage for PyMOL: tests
sudo dnf install pymol+tests- License: MIT-0 AND BSD-2-Clause AND BSD-3-Clause AND Bitstream-Vera AND OFL-1.1
- Category: Unspecified
- Architecture: x86_64
- Source Package: pymol
- 3 Dépendances
- 1 fournit
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
pacman95%
pymol 3.1.0-6
Molecular visualization system on an Open Source foundation
sudo pacman -S pymol- License: custom
- Architecture: x86_64
- 12 Dépendances
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
zypper95%
python313-pymol 3.1.0-4.5
A Molecular Viewer
sudo zypper install python313-pymol- License: Python-2.0
- Category: Unspecified
- Architecture: x86_64
- Source Package: python-pymol
- 16 Dépendances
- 5 fournit
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
zypper95%
python314-pymol 3.1.0-4.5
A Molecular Viewer
sudo zypper install python314-pymol- License: Python-2.0
- Category: Unspecified
- Architecture: x86_64
- Source Package: python-pymol
- 16 Dépendances
- 4 fournit
- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
MacPorts95%
pymol
sudo port install pymol- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
winget95%
Schrodinger.PyMOL
winget install --id Schrodinger.PyMOL -e- normalized package name match
- Correspondance par : Pymol
piste source
Généré depuis les données du dépôt
Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Sources utilisées
- Geiger risk classifier
- cross-ecosystem install command graph
- curated configuration and credential file locations
- curated package history
- external package-manager database matches
- package relationship graph
- package version freshness
- package-page enrichment
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation