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brew / rang 6016

Installer beast avec Homebrew

Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de beast pour les workflows d'agents IA.

Commande d'installationNotes de sécurité

installation

Commandes d'installation supplémentaires

macOS

Homebrewvérifié · 100%
brew install beast

local Homebrew formula metadata

aperçu

Résumé du paquet

Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees

Commandes et alias

  • beast
  • beauti
  • loganalyser
  • logcombiner
  • treeannotator
  • treestat

historique

Historique du projet et usages

BEAST is Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees, a scientific software package for Bayesian phylogenetic analysis of molecular sequences using MCMC.

Historique du projet

The official documentation describes BEAST as focused on rooted, time-measured phylogenies, strict or relaxed molecular-clock models, coalescent population models, and Bayesian model testing.

The official About page credits Alexei J. Drummond, Andrew Rambaut, and Marc A. Suchard as designers and developers, with a large contributor and institutional-support history across evolutionary-analysis research.

Historique d'adoption

BEAST's adoption is primarily academic and scientific rather than general developer tooling. The official README distributes binaries for Mac, Windows, and UNIX/Linux and the Homebrew package exposes the command-line programs for Unix package users.

The supplied Homebrew metadata includes executables such as beast, beauti, loganalyser, logcombiner, treeannotator, and treestat, reflecting the suite-style workflow used to set up analyses, run MCMC, and inspect results.

Modes d'utilisation

Typical BEAST workflows use BEAUti to prepare XML analysis files, beast to run Bayesian MCMC analyses, and companion tools such as LogAnalyser, LogCombiner, TreeAnnotator, and TreeStat to inspect or summarize outputs.

The package is Java-based and cross-platform, but the Homebrew formula makes its command-line tools available in the same way as other scientific CLI suites.

Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent

BEAST is significant as a package because it brings a full research-grade phylogenetics suite into package-manager workflows. It is not a small Unix filter, but Homebrew makes the JVM-backed analysis tools installable and scriptable beside other scientific software.

Chronologie

  • 2015: The official GitHub repository for beast-mcmc was created.
  • 2016: The GitHub releases include BEAST v1.8.4.
  • 2018: The GitHub releases include BEAST v1.10.4, identified by the README as the previous major release.
  • 2025: The GitHub releases include BEAST X v10.5.0.
  • 2026: The official site and repository continue to describe BEAST X and recent beta releases.

Related projects

  • BEAUti, LogAnalyser, LogCombiner, TreeAnnotator, and TreeStat are bundled companion programs in the BEAST workflow.
  • BEAST 2 is a related project in the broader BEAST ecosystem, but this Homebrew package points at the beast-mcmc repository and BEAST X documentation.

posture de sécurité

Aucune couverture d'outil protégé trouvée pour le moment

Aucun manifest local de gestion des secrets correspondant n'a été trouvé pour beast. Les métadonnées de paquet restent publiées ici afin que la couverture future dispose d'une URL stable.

Comportement d'installation

  • Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
  • Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.
  • S’installe avec 2 dépendances d’exécution.
  • Les métadonnées de compilation listent 1 dépendances de compilation.

Revue recommandée

Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.

exécutables

Exécutables installés

CommandeTypeExpositionNote
beastcliexécutable global
beauticliexécutable global
loganalysercliexécutable global
logcombinercliexécutable global
treeannotatorcliexécutable global
treestatcliexécutable global

fraîcheur

Version et fraîcheur

Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.

page générée2026-08-04
version du gestionnaire10.5.0
gestionnaire mis à jour2026-05-20
données localesOK
amontà jour
dernière version détectéev10.5.0

https://github.com/beast-dev/beast-mcmc

  • OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.

métadonnées d'installation

Métadonnées du paquet

Clé du paquetbrew:beast
Version10.5.0
Gestionnaire de paquetsHomebrew
Page du gestionnaire de paquetshttps://formulae.brew.sh/formula/beast
Page d'accueilhttps://beast.community/
Dépôthttps://github.com/beast-dev/beast-mcmc
Docs amonthttps://beast.community/
LicenceLGPL-2.1-or-later
Archive sourcehttps://github.com/beast-dev/beast-mcmc/archive/refs/tags/v10.5.0.tar.gz
Dernière mise à jour2026-05-20T10:15:39Z
Pulseupdated
Dépendancesbeagle, openjdk@25
Dépendances de compilationant
Bouteilledisponible (sur arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
post-install Homebrewnon défini
Serviceaucun déclaré

faits du registre

Détails de la base source

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Namebeast
Version Scheme0
Revision0
Head VersionHEAD
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • head
  • stable

graphe de paquets

Les liens viennent du graphe local de relations entre paquets, des suppléments, des dépendances, des correspondances d'écosystèmes et de l'appartenance aux hubs.

Outils liés

  • openjdk@25Runtime dependency declared by Homebrew.
  • antBuild dependency declared by Homebrew.

Même workflow

  • mrbayesShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, mcmc, phylogenetics, science.
  • picard-toolsShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, java, science.
  • raxml-ngShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, phylogenetics, science.
  • pamlShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, phylogenetics, science.
  • fastmeShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, phylogenetics, science.
  • samtoolsShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, science.

piste source

Généré depuis les données du dépôt

Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.

Sources utilisées

  • Geiger risk classifier
  • cross-ecosystem install command graph
  • curated package history
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment
  • pkg.so package database
  • pkgdb category and tag curation