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Homebrewverifiziert · 100%

brew install beast

local Homebrew formula metadata

Überblick

Paketzusammenfassung

Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees

Projektlinks

Befehle und Aliase

beast
beauti
loganalyser
logcombiner
treeannotator
treestat

Verlauf

Projektgeschichte und Nutzung

BEAST is Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees, a scientific software package for Bayesian phylogenetic analysis of molecular sequences using MCMC.

Projektgeschichte

The official documentation describes BEAST as focused on rooted, time-measured phylogenies, strict or relaxed molecular-clock models, coalescent population models, and Bayesian model testing.

The official About page credits Alexei J. Drummond, Andrew Rambaut, and Marc A. Suchard as designers and developers, with a large contributor and institutional-support history across evolutionary-analysis research.

Adoptionsgeschichte

BEAST's adoption is primarily academic and scientific rather than general developer tooling. The official README distributes binaries for Mac, Windows, and UNIX/Linux and the Homebrew package exposes the command-line programs for Unix package users.

The supplied Homebrew metadata includes executables such as beast, beauti, loganalyser, logcombiner, treeannotator, and treestat, reflecting the suite-style workflow used to set up analyses, run MCMC, and inspect results.

Wie es verwendet wird

Typical BEAST workflows use BEAUti to prepare XML analysis files, beast to run Bayesian MCMC analyses, and companion tools such as LogAnalyser, LogCombiner, TreeAnnotator, and TreeStat to inspect or summarize outputs.

The package is Java-based and cross-platform, but the Homebrew formula makes its command-line tools available in the same way as other scientific CLI suites.

Warum Paket-Nerds sich dafür interessieren

BEAST is significant as a package because it brings a full research-grade phylogenetics suite into package-manager workflows. It is not a small Unix filter, but Homebrew makes the JVM-backed analysis tools installable and scriptable beside other scientific software.

Zeitleiste

2015: The official GitHub repository for beast-mcmc was created.
2016: The GitHub releases include BEAST v1.8.4.
2018: The GitHub releases include BEAST v1.10.4, identified by the README as the previous major release.
2025: The GitHub releases include BEAST X v10.5.0.
2026: The official site and repository continue to describe BEAST X and recent beta releases.

Related projects

BEAUti, LogAnalyser, LogCombiner, TreeAnnotator, and TreeStat are bundled companion programs in the BEAST workflow.
BEAST 2 is a related project in the broader BEAST ecosystem, but this Homebrew package points at the beast-mcmc repository and BEAST X documentation.

Quellen

https://beast.community/
https://beast.community/about
https://github.com/beast-dev/beast-mcmc#readme
https://github.com/beast-dev/beast-mcmc/releases
input.json source_facts.executables

Sicherheitslage

Noch keine Protected-Tool-Abdeckung gefunden

Für beast wurde kein passendes lokales Secret-Handling-Manifest gefunden. Paketmetadaten bleiben hier veröffentlicht, damit künftige Abdeckung eine stabile Paket-URL hat.

Installationsverhalten

In den Formelmetadaten ist kein Homebrew-Post-install-Hook erfasst.
Homebrew-Bottle-Metadaten sind für 6 Plattformziele verfügbar.
Installiert mit 2 Laufzeitabhängigkeiten.
Build-Metadaten listen 1 Build-Abhängigkeiten.

Empfohlene Prüfung

Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.

Executables

Installierte Executables

Befehl	Art	Sichtbarkeit
`beast`	cli	globales Executable
`beauti`	cli	globales Executable
`loganalyser`	cli	globales Executable
`logcombiner`	cli	globales Executable
`treeannotator`	cli	globales Executable
`treestat`	cli	globales Executable

Aktualität

Version und Aktualität

Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.

Seite generiert2026-08-04

Manager-Version10.5.0

Manager aktualisiert2026-05-20

lokale DatenOK

Upstreamaktuell

neueste erkannte Versionv10.5.0

https://github.com/beast-dev/beast-mcmc

OKEs wurden keine Aktualitätswarnungen generiert.

Installationsmetadaten

Paketmetadaten

Paketschlüssel	brew:beast
Version	10.5.0
Paketmanager	Homebrew
Paketmanager-Seite	https://formulae.brew.sh/formula/beast
Homepage	https://beast.community/
Repository	https://github.com/beast-dev/beast-mcmc
Upstream-Dokumentation	https://beast.community/
Lizenz	LGPL-2.1-or-later
Quellarchiv	https://github.com/beast-dev/beast-mcmc/archive/refs/tags/v10.5.0.tar.gz
Zuletzt aktualisiert	2026-05-20T10:15:39Z
Pulse	updated
Abhängigkeiten	beagle, openjdk@25
Build-Abhängigkeiten	ant
Bottle	verfügbar (auf arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install	nicht definiert
Dienst	keiner deklariert

Registry-Fakten

Details aus der Quelldatenbank

Source Database	Homebrew formula API
Tap	homebrew/core
Full Name	beast
Version Scheme	0
Revision	0
Head Version	HEAD
Bottle Stable Root URL	https://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecated	no
Disabled	no
Keg Only	no
URL Keys	head stable

Paketgraph

Links stammen aus dem lokalen Paketbeziehungsgraph, Ergänzungen, Abhängigkeitskanten, Ecosystem-Matches und Paket-Hub-Mitgliedschaft.

Quellspur

Aus Repository-Daten generiert

Diese Seite wird von av-web aus dem privaten Paket-SQLite-Artefakt bereitgestellt, das scripts/generate-pkg-sqlite.py erstellt.

Combined YAML source

View the package source record on GitHub.

combined/beast.yml

Verwendete Quellen

Geiger risk classifier
cross-ecosystem install command graph
curated package history
package relationship graph
package version freshness
package-page enrichment
pkg.so package database
pkgdb category and tag curation

beast mit Homebrew installieren