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Homebrew確認済み · 100%
brew install sylphlocal Homebrew formula metadata
brew / 順位 14260
sylph を Homebrew でインストール
sylph のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。
インストール
追加のインストールコマンド
概要
パッケージ概要
Ultrafast taxonomic profiling and genome querying for metagenomic samples
プロジェクトリンク
コマンドとエイリアス
- sylph
履歴
プロジェクトの歴史と使われ方
sylph is a Rust command-line tool for fast metagenomic profiling and containment average nucleotide identity querying from shotgun sequencing samples. It is packaged for scientists who want a small executable that can query or profile large genome databases quickly from the shell.
プロジェクトの歴史
The official documentation describes sylph as a program for metagenomic profiling and containment ANI querying. Its core method uses k-mer containment with a statistical technique for low-coverage genomes, and the documentation cites the 2024 Nature Biotechnology paper by Jim Shaw and Yun William Yu.
採用の歴史
The upstream README and documentation document installation through Bioconda, source builds with Rust/Cargo, and prebuilt x86-64 Linux binaries; the input package facts show Homebrew packaging as well. That mix reflects a bioinformatics CLI moving through both scientific package channels and general-purpose developer package managers.
使われ方
Common usage is to run sylph profile against a prebuilt or custom database, such as GTDB, with paired-end or single-end FASTQ files, or to run ANI querying to test whether a sample contains a genome related to a queried reference. The docs emphasize fast multi-sample profiling, custom databases, prebuilt databases, and support for short or long reads.
パッケージ好きにとっての重要性
Package nerds care because sylph is a modern scientific CLI distributed as a Rust binary: it needs reproducible installation, large external databases, predictable CPU/RAM behavior, and channels such as Bioconda and Homebrew to reach different user communities.
タイムライン
- 2024: Official documentation cites the sylph Nature Biotechnology paper by Jim Shaw and Yun William Yu.
- Current README era: The GitHub README says all documentation moved to sylph-docs.github.io.
- Homebrew packaging: The input package facts identify sylph as a Homebrew formula exposing the sylph executable.
Related projects
- Related tools and references named by the official docs include Kraken, MetaPhlAn, mOTUs, GTDB databases, Bioconda, Rust/Cargo, and sylph-tax.
ソース
- https://github.com/bluenote-1577/sylph
- https://github.com/bluenote-1577/sylph/blob/main/README.md
- https://sylph-docs.github.io/
- source_facts.executables
- source_facts.package-manager
セキュリティ状態
リスクレベル: グリーン
narrow executable package without higher-risk signals.
リスク分類器
リスク グリーン · 信頼度 低 · appliance
理由
- narrow executable package without higher-risk signals
信号
- metadata:no-higher-risk-signals
インストール挙動
- Homebrew bottle メタデータは記録されていません。
推奨レビュー
エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。
実行可能ファイル
インストールされる実行可能ファイル
| コマンド | 種類 | 公開範囲 | メモ |
|---|---|---|---|
sylph | 実行可能ファイル | インデックス済み実行可能ファイル | ローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。 |
鮮度
バージョンと鮮度
これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。
ページ生成日2026-08-03
マネージャ版0.9.0
マネージャ更新日
ローカルデータ不明
上流利用不可
検出された最新未検出
- OK鮮度警告は生成されていません。
インストールメタデータ
パッケージメタデータ
| パッケージキー | brew:sylph |
|---|---|
| バージョン | 0.9.0 |
| パッケージマネージャ | Homebrew |
| ホームページ | https://github.com/bluenote-1577/sylph |
| リポジトリ | https://github.com/bluenote-1577/sylph |
| Bottle | 未記録 |
| サービス | 宣言なし |
ソース経路
リポジトリデータから生成
このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
使用ソース
- Geiger risk classifier
- cross-ecosystem install command graph
- curated package history
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation