# proteinortho を Homebrew, apt でインストール

proteinortho のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。

## インストール

```sh
sudo av install brew:proteinortho
```

追加のインストールコマンド:

### macOS

- Homebrew (100%):

```sh
brew install proteinortho
```

  証拠: local Homebrew formula metadata

### Linux

- Debian apt (92%):

```sh
sudo apt install proteinortho
```

  証拠: Debian stable package indexes: proteinortho from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

## パッケージ情報

- **パッケージキー:** brew:proteinortho
- **パッケージマネージャ:** Homebrew
- **バージョン:** 6.3.6
- **ソース概要:** Detecting orthologous genes within different species
- **ホームページ:** <https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho>
- **最終更新:** 2026-06-25T13:38:03+02:00
- **生成日時:** 2026-08-03T19:37:03+00:00

## 実行可能ファイル

- proteinortho (エイリアス)
- proteinortho2html.pl (エイリアス)
- proteinortho2tree.pl (エイリアス)
- proteinortho2xml.pl (エイリアス)
- proteinortho6.pl (エイリアス)
- proteinortho_cleanupblastgraph (エイリアス)
- proteinortho_clustering (エイリアス)
- proteinortho_compareProteinorthoGraphs.pl (エイリアス)
- proteinortho_do_mcl.pl (エイリアス)
- proteinortho_extract_from_graph.pl (エイリアス)
- proteinortho_ffadj_mcs.py (エイリアス)
- proteinortho_formatUsearch.pl (エイリアス)
- proteinortho_grab_proteins.pl (エイリアス)
- proteinortho_graphMinusRemovegraph (エイリアス)
- proteinortho_history.pl (エイリアス)
- proteinortho_singletons.pl (エイリアス)
- proteinortho_summary.pl (エイリアス)

## インストール挙動

- Bottle: 利用不可

## バージョンと鮮度

- ページ生成日: 2026-08-03
- マネージャ版: 6.3.6

## セキュリティノート

infrastructure mutation or orchestration signal.

- **Geiger リスク:** orange / 中
- infrastructure mutation or orchestration signal

## 他のパッケージマネージャ記録

- Debian apt - proteinortho - 6.3.1+dfsg-1: normalized package name match | Debian stable package indexes: proteinortho from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz | Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis | https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho
- Ubuntu apt - proteinortho - 6.3.1+dfsg-1: normalized package name match | Ubuntu 24.04 LTS package indexes: proteinortho from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz | Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis | https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho


## Combined YAML source

View the package source record on GitHub. [combined/proteinortho.yml](https://github.com/mxcl/pkgdb/blob/main/combined/proteinortho.yml)


## ソース

- pkg.so package database
- Geiger risk classifier
- pkgdb category and tag curation
- external package-manager database matches
- cross-ecosystem install command graph