pkg.soopen package index

brew / 順位 7367

proteinortho を Homebrew, apt でインストール

proteinortho のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。

インストールコマンドセキュリティノート

インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%
brew install proteinortho

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian apt確認済み · 92%
sudo apt install proteinortho

Debian stable package indexes · proteinortho · ソース: deb.debian.org

概要

パッケージ概要

Detecting orthologous genes within different species

コマンドとエイリアス

  • proteinortho
  • proteinortho2html.pl
  • proteinortho2tree.pl
  • proteinortho2xml.pl
  • proteinortho6.pl
  • proteinortho_cleanupblastgraph
  • proteinortho_clustering
  • proteinortho_compareProteinorthoGraphs.pl
  • proteinortho_do_mcl.pl
  • proteinortho_extract_from_graph.pl
  • proteinortho_ffadj_mcs.py
  • proteinortho_formatUsearch.pl
  • proteinortho_grab_proteins.pl
  • proteinortho_graphMinusRemovegraph
  • proteinortho_history.pl
  • proteinortho_singletons.pl
  • proteinortho_summary.pl

セキュリティ状態

リスクレベル: orange

infrastructure mutation or orchestration signal.

リスク分類器

リスク orange · 信頼度 中 · infrastructure

理由

  • infrastructure mutation or orchestration signal

信号

  • text:cluster

インストール挙動

  • Homebrew bottle メタデータは記録されていません。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド種類公開範囲メモ
proteinortho実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho2html.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho2tree.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho2xml.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho6.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_cleanupblastgraph実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_clustering実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_compareProteinorthoGraphs.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_do_mcl.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_extract_from_graph.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_ffadj_mcs.py実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_formatUsearch.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_grab_proteins.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_graphMinusRemovegraph実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_history.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_singletons.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
proteinortho_summary.pl実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-08-03
マネージャ版6.3.6
マネージャ更新日2026-06-25
ローカルデータ不明
上流利用不可
検出された最新未検出
  • OK鮮度警告は生成されていません。

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキーbrew:proteinortho
バージョン6.3.6
パッケージマネージャHomebrew
ホームページhttps://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho
最終更新2026-06-25T13:38:03+02:00
Pulseupdated
Bottle未記録
サービス宣言なし

ソースデータベース一致

他のパッケージマネージャ記録

一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。

Debian apt95%

proteinortho 6.3.1+dfsg-1

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho

sudo apt install proteinortho
  • Section: science
  • Architecture: amd64
  • 10 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Proteinortho
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: proteinortho from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Ubuntu apt95%

proteinortho 6.3.1+dfsg-1

Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis

https://gitlab.com/paulklemm_PHD/proteinortho

sudo apt install proteinortho
  • Section: universe/science
  • Architecture: amd64
  • 10 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Proteinortho
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: proteinortho from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

エージェント安全ガイド

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

使用ソース

  • Geiger risk classifier
  • cross-ecosystem install command graph
  • external package-manager database matches
  • pkg.so package database
  • pkgdb category and tag curation