pkg.soopen package index

brew / 順位 7640

paml を Homebrew, apt, Nix でインストール

paml のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。

インストールコマンドセキュリティノート

インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%
brew install paml

local Homebrew formula metadata

Linux

Debian apt確認済み · 92%
sudo apt install paml

Debian stable package indexes · paml · ソース: deb.debian.org

Nix確認済み · 92%
nix profile install nixpkgs#paml

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/pa/paml/package.nix · ソース: api.github.com

概要

パッケージ概要

Phylogenetic analyses of DNA or protein sequences using maximum likelihood

コマンドとエイリアス

  • baseml
  • basemlg
  • chi2
  • codeml
  • evolver
  • infinitesites
  • mcmctree
  • pamp
  • yn00

セキュリティ状態

リスクレベル: グリーン

narrow executable package without higher-risk signals.

リスク分類器

リスク グリーン · 信頼度 低 · appliance

理由

  • narrow executable package without higher-risk signals

信号

  • metadata:no-higher-risk-signals

インストール挙動

  • Homebrew bottle メタデータは記録されていません。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド種類公開範囲メモ
baseml実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
basemlg実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
chi2実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
codeml実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
evolver実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
infinitesites実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
mcmctree実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
pamp実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。
yn00実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-08-03
マネージャ版4.10.10
マネージャ更新日
ローカルデータ不明
上流利用不可
検出された最新未検出
  • OK鮮度警告は生成されていません。

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキーbrew:paml
バージョン4.10.10
パッケージマネージャHomebrew
ホームページhttps://github.com/abacus-gene/paml
リポジトリhttps://github.com/abacus-gene/paml
Bottle未記録
サービス宣言なし

ソースデータベース一致

他のパッケージマネージャ記録

一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。

Debian apt95%

paml 4.9j+dfsg-6

Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)

http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html

sudo apt install paml
  • Section: science
  • Architecture: amd64
  • 1 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Paml
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: paml from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt95%

paml-doc 4.9j+dfsg-6

Documentation for PAML

http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html

sudo apt install paml-doc
  • Section: doc
  • Architecture: all
  • Source Package: paml
  • normalized package name match
  • 一致条件: Paml
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: paml-doc from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Nix95%

paml

nix profile install nixpkgs#paml
  • normalized package name match
  • 一致条件: Paml
nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/pa/paml/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1
Ubuntu apt95%

paml 4.9j+dfsg-4

Phylogenetic Analysis by Maximum Likelihood (PAML)

http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html

sudo apt install paml
  • Section: universe/science
  • Architecture: amd64
  • 1 依存関係
  • normalized package name match
  • 一致条件: Paml
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: paml from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
Ubuntu apt95%

paml-doc 4.9j+dfsg-4

Documentation for PAML

http://abacus.gene.ucl.ac.uk/software/paml.html

sudo apt install paml-doc
  • Section: universe/doc
  • Architecture: all
  • Source Package: paml
  • normalized package name match
  • 一致条件: Paml
Ubuntu 24.04 LTS package indexes · archive.ubuntu.com · Ubuntu 24.04 LTS package indexes: paml-doc from https://archive.ubuntu.com/ubuntu/dists/noble/universe/binary-amd64/Packages.gz
Debian apt92%

evolver 2.70+ds-8

Surface Evolver

https://facstaff.susqu.edu/brakke/evolver/evolver.html

sudo apt install evolver
  • Section: math
  • Architecture: all
  • 2 依存関係
  • installed executable or alias match
  • 一致条件: Evolver
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: evolver from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt92%

evolver-doc 2.70+ds-8

Surface Evolver - doc

https://facstaff.susqu.edu/brakke/evolver/evolver.html

sudo apt install evolver-doc
  • Section: doc
  • Architecture: all
  • Source Package: evolver
  • 2 任意依存関係
  • installed executable or alias match
  • 一致条件: Evolver
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: evolver-doc from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt92%

evolver-nox 2.70+ds-8+b2

Surface Evolver - with no X support

https://facstaff.susqu.edu/brakke/evolver/evolver.html

sudo apt install evolver-nox
  • Section: math
  • Architecture: amd64
  • Source Package: evolver
  • 3 依存関係
  • 1 提供
  • 2 任意依存関係
  • installed executable or alias match
  • 一致条件: Evolver
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: evolver-nox from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz
Debian apt92%

evolver-ogl 2.70+ds-8+b2

Surface Evolver - with OpenGL display

https://facstaff.susqu.edu/brakke/evolver/evolver.html

sudo apt install evolver-ogl
  • Section: math
  • Architecture: amd64
  • Source Package: evolver
  • 7 依存関係
  • 1 提供
  • 2 任意依存関係
  • installed executable or alias match
  • 一致条件: Evolver
Debian stable package indexes · deb.debian.org · Debian stable package indexes: evolver-ogl from https://deb.debian.org/debian/dists/stable/main/binary-amd64/Packages.xz

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

エージェント安全ガイド

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

使用ソース

  • Geiger risk classifier
  • cross-ecosystem install command graph
  • external package-manager database matches
  • pkg.so package database
  • pkgdb category and tag curation