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brew / 順位 19303

nanoq を Homebrew でインストール

nanoq のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。

インストールコマンドセキュリティノート

インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%
brew install nanoq

local Homebrew formula metadata

概要

パッケージ概要

Minimal but speedy quality control and summaries of nanopore reads

コマンドとエイリアス

  • nanoq

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

Nanoq is a Rust command-line utility for rapid filtering, trimming, quality control, and summary reporting of Oxford Nanopore FASTA/FASTQ reads. It is designed to work with files or Unix streams and emphasizes low memory use and high throughput.

プロジェクトの歴史

The public repository and first tagged releases appeared in March 2020. The project subsequently expanded its filters, reports, compression support, and machine-readable output, reaching the 0.8 series in 2021, 0.9.0 in 2022, and 0.10.0 in 2023. Steinig and Coin described Nanoq in the Journal of Open Source Software in 2022.

採用の歴史

Nanoq is distributed through Cargo, Conda/Bioconda, precompiled Linux and macOS release archives, and a Homebrew formula. Its official benchmarks position it alongside established sequencing utilities including NanoFilt, NanoStat, Filtlong, seqtk, SeqKit, and rust-bio-tools.

使われ方

Users pass FASTA or FASTQ reads by file or standard input, apply length or quality filters and optional end trimming, and send surviving reads to a file or standard output. Statistics can be emitted as compact text, verbose summaries, or JSON; a fast mode skips quality-score calculation for greater throughput.

パッケージ好きにとっての重要性

Nanoq is notable as a small, single-purpose Rust CLI that composes naturally in Unix pipelines while being packaged across the Rust, bioinformatics, binary-release, and Homebrew ecosystems. Its benchmarked trade-off between full quality calculations and an exceptionally fast quality-free mode makes it useful when choosing lightweight tools for large sequencing streams.

タイムライン

  • 2020: First public tagged releases.
  • 2021: The 0.8 release series broadened the mature CLI.
  • 2022: Nanoq was published in the Journal of Open Source Software and version 0.9.0 was released.
  • 2023: Version 0.10.0 was released.

Related projects

  • NanoFilt and NanoStat provide nanopore filtering and statistics workflows used as official benchmark comparisons.
  • Filtlong, seqtk, SeqKit, and rust-bio-tools are neighboring read-processing tools compared in Nanoq's official benchmarks.
  • Needletail and niffler provide Nanoq's read-processing and compression foundations.

セキュリティ状態

保護ツール対応はまだ見つかっていません

nanoq に一致するローカルシークレット処理マニフェストは見つかりませんでした。将来の対応で安定したパッケージ URL を使えるよう、Nucleus パッケージメタデータはここに公開されています。

インストール挙動

  • Homebrew bottle メタデータは記録されていません。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド種類公開範囲メモ
nanoq実行可能ファイルインデックス済み実行可能ファイルローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-08-03
マネージャ版0.10.0
マネージャ更新日2026-07-14
ローカルデータ不明
上流利用不可
検出された最新未検出
  • OK鮮度警告は生成されていません。

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキーbrew:nanoq
バージョン0.10.0
パッケージマネージャHomebrew
ホームページhttps://github.com/esteinig/nanoq
リポジトリhttps://github.com/esteinig/nanoq
最終更新2026-07-14T06:59:42Z
Pulseupdated
Bottle未記録
サービス宣言なし

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

エージェント安全ガイド

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

使用ソース

  • cross-ecosystem install command graph
  • curated package history
  • pkg.so package database
  • pkgdb category and tag curation