# minibwa を Homebrew でインストール

minibwa のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。

## インストール

```sh
sudo av install brew:minibwa
```

追加のインストールコマンド:

### macOS

- Homebrew (100%):

```sh
brew install minibwa
```

  証拠: local Homebrew formula metadata

## パッケージ情報

- **パッケージキー:** brew:minibwa
- **パッケージマネージャ:** Homebrew
- **バージョン:** 0.6
- **ソース概要:** Successor of BWA-MEM for short-read alignment
- **ホームページ:** <https://github.com/lh3/minibwa>
- **リポジトリ:** <https://github.com/lh3/minibwa>
- **最終更新:** 2026-07-30T15:48:22Z
- **生成日時:** 2026-08-03T19:37:03+00:00

## 実行可能ファイル

- minibwa (エイリアス)

## インストール挙動

- Bottle: 利用不可

## バージョンと鮮度

- ページ生成日: 2026-08-03
- マネージャ版: 0.6
## プロジェクトの歴史と使われ方

minibwa is a genomic read aligner from the BWA/minimap2 lineage. The repository identifies it as the successor of BWA-MEM for short-read alignment, and the arXiv preprint by Heng Li and Nils Homer presents it as a next iteration of BWA-MEM for standard whole-genome short reads, Hi-C reads, accurate long reads, and directional bisulfite sequencing data.

### プロジェクトの歴史

The design deliberately mixes earlier tools by the same lineage: a BWA-MEM-style BWT/FM-index and variable-length seed search, ropebwt3-inspired supermaximal exact-match work, and minimap2-style chaining plus SIMD-based base alignment. The authors report comparable accuracy with much higher speed than BWA-MEM and BWA-MEM2, while noting that exact BWA-MEM compatibility is traded for algorithmic improvement.

### 使われ方

In practice, minibwa is a bioinformatics command-line aligner for pipelines that map sequencing reads to a reference genome before variant calling, methylation analysis, or related downstream analysis. Its package-manager niche is narrow but important: it gives genomics users an installable replacement candidate for BWA-MEM where performance and support for newer read types matter more than byte-for-byte legacy output.

### ソース

- <https://arxiv.org/abs/2606.15357>
- <https://arxiv.org/html/2606.15357v1>
- <https://github.com/lh3/bwa>
- <https://github.com/lh3/minibwa>


## セキュリティノート

minibwa に一致するローカルシークレット処理マニフェストは見つかりませんでした。将来の対応で安定したパッケージ URL を使えるよう、Nucleus パッケージメタデータはここに公開されています。



## Combined YAML source

View the package source record on GitHub. [combined/minibwa.yml](https://github.com/mxcl/pkgdb/blob/main/combined/minibwa.yml)


## ソース

- pkg.so package database
- curated package history
- pkgdb category and tag curation
- cross-ecosystem install command graph