macOS
Homebrew確認済み · 100%
brew install lastzlocal Homebrew formula metadata
brew / 順位 13396
lastz を Homebrew, apt でインストール
lastz のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。
インストール
追加のインストールコマンド
Linux
Debian apt確認済み · 92%
sudo apt install lastzDebian stable package indexes · lastz · ソース: deb.debian.org
概要
パッケージ概要
Pairwise aligner for DNA sequences
履歴
プロジェクトの歴史と使われ方
LASTZ is a pairwise DNA sequence aligner and the successor-style, command-line-compatible replacement for BLASTZ. It is used for comparing genomic sequences and can emit formats used by genome-alignment pipelines, including LAV, AXT, MAF, SAM, CIGAR, PAF, and human-readable output.
プロジェクトの歴史
The official documentation presents LASTZ as a drop-in replacement for BLASTZ that preserves BLASTZ command-line syntax while adding options and correcting behavioral problems. Its documentation includes an explicit section on differences from BLASTZ, such as fixes to alignment-boundary behavior, premature termination, chaining overflow, ambiguity handling, and additional output formats.
The GitHub repository was created on 2016-08-11 and is described by the project as the official working branch, with users encouraged to use tagged releases. Tagged 1.04.x releases continued the project's bioinformatics-maintenance role after the BLASTZ era.
採用の歴史
LASTZ is packaged in Homebrew, Debian, and Ubuntu and appears in high-performance-computing genomics documentation because pairwise whole-genome and read-to-reference alignment remain recurring batch-computing tasks. Its BLASTZ compatibility helped existing workflows migrate without rewriting every command line.
The adoption pattern is typical of scientific command-line tools: a stable executable, long HTML manual, tagged source releases, and distribution packages matter more than a polished end-user application interface.
使われ方
Users run `lastz` with target and query sequences plus scoring, seeding, masking, chaining, and output-format options. The manual's examples cover comparing chromosomes, aligning shotgun reads to a chromosome, self-alignment, and working with seed, HSP, gapped-alignment, and chaining stages.
パッケージ好きにとっての重要性
LASTZ is package-nerd significant because it is a specialized scientific CLI whose real value is reproducibility: exact versions, tagged releases, and package-manager availability let genomics pipelines rerun large alignments with known behavior.
It also illustrates a common packaging problem in bioinformatics: preserving old command-line compatibility while fixing algorithmic bugs and adding formats needed by newer workflows.
タイムライン
- 2016-08-11: Official GitHub repository created.
- 2017-04-12: Tag 1.04.00 appears in the public GitHub tag set.
- 2022-01-11: Tag 1.04.52 appears in the public GitHub tag set.
- 2026-05-20: GitHub repository metadata records activity on the official repository.
Related projects
- LASTZ is directly related to BLASTZ, the Miller Lab alignment tools, and downstream genome-alignment formats and pipelines that consume LAV, AXT, MAF, SAM, CIGAR, or PAF output.
ソース
セキュリティ状態
リスクレベル: グリーン
narrow executable package without higher-risk signals.
リスク分類器
リスク グリーン · 信頼度 低 · appliance
理由
- narrow executable package without higher-risk signals
信号
- metadata:no-higher-risk-signals
インストール挙動
- Homebrew bottle メタデータは記録されていません。
推奨レビュー
エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。
実行可能ファイル
インストールされる実行可能ファイル
| コマンド | 種類 | 公開範囲 | メモ |
|---|---|---|---|
lastz | 実行可能ファイル | インデックス済み実行可能ファイル | ローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。 |
lastz_D | 実行可能ファイル | インデックス済み実行可能ファイル | ローカル実行可能ファイルインデックスから検出されました。 |
鮮度
バージョンと鮮度
これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。
ページ生成日2026-08-03
マネージャ版1.04.52
マネージャ更新日
ローカルデータ不明
上流利用不可
検出された最新未検出
- OK鮮度警告は生成されていません。
インストールメタデータ
パッケージメタデータ
| パッケージキー | brew:lastz |
|---|---|
| バージョン | 1.04.52 |
| パッケージマネージャ | Homebrew |
| ホームページ | https://lastz.github.io/lastz/ |
| リポジトリ | https://github.com/lastz/lastz |
| Bottle | 未記録 |
| サービス | 宣言なし |
ソースデータベース一致
他のパッケージマネージャ記録
一致は外部パッケージマネージャインデックスから取得され、ローカルの Automic Vault パッケージリンクとは分けて表示されます。
Debian apt95%
lastz 1.04.22-2
pairwise aligning DNA sequences
https://github.com/lastz/lastz
sudo apt install lastz- Section: science
- Architecture: amd64
- 1 依存関係
- normalized package name match
- 一致条件: Lastz
Debian apt95%
lastz-examples 1.04.22-2
pairwise aligning DNA sequences (examples and test scripts)
https://github.com/lastz/lastz
sudo apt install lastz-examples- Section: science
- Architecture: all
- Source Package: lastz
- 1 依存関係
- normalized package name match
- 一致条件: Lastz
Ubuntu apt95%
lastz 1.04.22-2
pairwise aligning DNA sequences
https://github.com/lastz/lastz
sudo apt install lastz- Section: universe/science
- Architecture: amd64
- 1 依存関係
- normalized package name match
- 一致条件: Lastz
Ubuntu apt95%
lastz-examples 1.04.22-2
pairwise aligning DNA sequences (examples and test scripts)
https://github.com/lastz/lastz
sudo apt install lastz-examples- Section: universe/science
- Architecture: all
- Source Package: lastz
- 1 依存関係
- normalized package name match
- 一致条件: Lastz
ソース経路
リポジトリデータから生成
このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
使用ソース
- Geiger risk classifier
- cross-ecosystem install command graph
- curated package history
- external package-manager database matches
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation