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brew install minibwalocal Homebrew formula metadata
brew / 順位 10313
minibwa のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。
インストール
brew install minibwalocal Homebrew formula metadata
概要
Successor of BWA-MEM for short-read alignment
履歴
minibwa is a genomic read aligner from the BWA/minimap2 lineage. The repository identifies it as the successor of BWA-MEM for short-read alignment, and the arXiv preprint by Heng Li and Nils Homer presents it as a next iteration of BWA-MEM for standard whole-genome short reads, Hi-C reads, accurate long reads, and directional bisulfite sequencing data.
The design deliberately mixes earlier tools by the same lineage: a BWA-MEM-style BWT/FM-index and variable-length seed search, ropebwt3-inspired supermaximal exact-match work, and minimap2-style chaining plus SIMD-based base alignment. The authors report comparable accuracy with much higher speed than BWA-MEM and BWA-MEM2, while noting that exact BWA-MEM compatibility is traded for algorithmic improvement.
In practice, minibwa is a bioinformatics command-line aligner for pipelines that map sequencing reads to a reference genome before variant calling, methylation analysis, or related downstream analysis. Its package-manager niche is narrow but important: it gives genomics users an installable replacement candidate for BWA-MEM where performance and support for newer read types matter more than byte-for-byte legacy output.
セキュリティ状態
minibwa に一致するローカルシークレット処理マニフェストは見つかりませんでした。将来の対応で安定したパッケージ URL を使えるよう、パッケージメタデータはここに公開されています。
エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。
実行可能ファイル
| コマンド | 種類 | 公開範囲 | メモ |
|---|---|---|---|
minibwa | cli | グローバル実行可能ファイル |
鮮度
これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。
https://github.com/lh3/minibwa
インストールメタデータ
| パッケージキー | brew:minibwa |
|---|---|
| バージョン | 0.6 |
| パッケージマネージャ | Homebrew |
| パッケージマネージャページ | https://formulae.brew.sh/formula/minibwa |
| ホームページ | https://github.com/lh3/minibwa |
| リポジトリ | https://github.com/lh3/minibwa |
| ライセンス | MIT AND Apache-2.0 |
| ソースアーカイブ | https://github.com/lh3/minibwa/archive/refs/tags/v0.6.tar.gz |
| 最終更新 | 2026-07-30T15:48:22Z |
| Pulse | updated |
| Bottle | 利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| Homebrew post-install | 未定義 |
| サービス | 宣言なし |
レジストリ情報
| Source Database | Homebrew formula API |
|---|---|
| Tap | homebrew/core |
| Full Name | minibwa |
| Version Scheme | 0 |
| Revision | 0 |
| Bottle Stable Root URL | https://ghcr.io/v2/homebrew/core |
| Deprecated | no |
| Disabled | no |
| Keg Only | no |
| URL Keys |
|
ソース経路
このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。
View the package source record on GitHub.