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brew / 順位 6016

beast を Homebrew でインストール

beast のインストール経路、実行ファイル、メタデータ、AI エージェント向けセキュリティノートを確認します。

インストールコマンドセキュリティノート

インストール

追加のインストールコマンド

macOS

Homebrew確認済み · 100%
brew install beast

local Homebrew formula metadata

概要

パッケージ概要

Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees

コマンドとエイリアス

  • beast
  • beauti
  • loganalyser
  • logcombiner
  • treeannotator
  • treestat

履歴

プロジェクトの歴史と使われ方

BEAST is Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees, a scientific software package for Bayesian phylogenetic analysis of molecular sequences using MCMC.

プロジェクトの歴史

The official documentation describes BEAST as focused on rooted, time-measured phylogenies, strict or relaxed molecular-clock models, coalescent population models, and Bayesian model testing.

The official About page credits Alexei J. Drummond, Andrew Rambaut, and Marc A. Suchard as designers and developers, with a large contributor and institutional-support history across evolutionary-analysis research.

採用の歴史

BEAST's adoption is primarily academic and scientific rather than general developer tooling. The official README distributes binaries for Mac, Windows, and UNIX/Linux and the Homebrew package exposes the command-line programs for Unix package users.

The supplied Homebrew metadata includes executables such as beast, beauti, loganalyser, logcombiner, treeannotator, and treestat, reflecting the suite-style workflow used to set up analyses, run MCMC, and inspect results.

使われ方

Typical BEAST workflows use BEAUti to prepare XML analysis files, beast to run Bayesian MCMC analyses, and companion tools such as LogAnalyser, LogCombiner, TreeAnnotator, and TreeStat to inspect or summarize outputs.

The package is Java-based and cross-platform, but the Homebrew formula makes its command-line tools available in the same way as other scientific CLI suites.

パッケージ好きにとっての重要性

BEAST is significant as a package because it brings a full research-grade phylogenetics suite into package-manager workflows. It is not a small Unix filter, but Homebrew makes the JVM-backed analysis tools installable and scriptable beside other scientific software.

タイムライン

  • 2015: The official GitHub repository for beast-mcmc was created.
  • 2016: The GitHub releases include BEAST v1.8.4.
  • 2018: The GitHub releases include BEAST v1.10.4, identified by the README as the previous major release.
  • 2025: The GitHub releases include BEAST X v10.5.0.
  • 2026: The official site and repository continue to describe BEAST X and recent beta releases.

Related projects

  • BEAUti, LogAnalyser, LogCombiner, TreeAnnotator, and TreeStat are bundled companion programs in the BEAST workflow.
  • BEAST 2 is a related project in the broader BEAST ecosystem, but this Homebrew package points at the beast-mcmc repository and BEAST X documentation.

セキュリティ状態

保護ツール対応はまだ見つかっていません

beast に一致するローカルシークレット処理マニフェストは見つかりませんでした。将来の対応で安定したパッケージ URL を使えるよう、パッケージメタデータはここに公開されています。

インストール挙動

  • formula メタデータに Homebrew post-install フックは記録されていません。
  • Homebrew bottle メタデータは 6 個のプラットフォームターゲットで利用できます。
  • 2 件の実行時依存関係とともにインストールされます。
  • ビルドメタデータには 1 件のビルド依存関係があります。

推奨レビュー

エージェントに無人実行させる前に、このツールが平文の認証情報を読むか、リモート状態を書き込むか、成果物を公開するか、プラグインを起動するかを確認してください。

実行可能ファイル

インストールされる実行可能ファイル

コマンド種類公開範囲メモ
beastcliグローバル実行可能ファイル
beauticliグローバル実行可能ファイル
loganalysercliグローバル実行可能ファイル
logcombinercliグローバル実行可能ファイル
treeannotatorcliグローバル実行可能ファイル
treestatcliグローバル実行可能ファイル

鮮度

バージョンと鮮度

これらの信号は、ページ生成時期、パッケージマネージャの活動、上流リリース比較を分けて示します。バージョン遅れは、証拠 URL と比較可能なバージョンがある場合だけ警告されます。

ページ生成日2026-08-04
マネージャ版10.5.0
マネージャ更新日2026-05-20
ローカルデータOK
上流最新
検出された最新v10.5.0

https://github.com/beast-dev/beast-mcmc

  • OK鮮度警告は生成されていません。

インストールメタデータ

パッケージメタデータ

パッケージキーbrew:beast
バージョン10.5.0
パッケージマネージャHomebrew
パッケージマネージャページhttps://formulae.brew.sh/formula/beast
ホームページhttps://beast.community/
リポジトリhttps://github.com/beast-dev/beast-mcmc
上流ドキュメントhttps://beast.community/
ライセンスLGPL-2.1-or-later
ソースアーカイブhttps://github.com/beast-dev/beast-mcmc/archive/refs/tags/v10.5.0.tar.gz
最終更新2026-05-20T10:15:39Z
Pulseupdated
依存関係beagle, openjdk@25
ビルド依存関係ant
Bottle利用可能 (対象 arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-install未定義
サービス宣言なし

レジストリ情報

ソースデータベース詳細

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Namebeast
Version Scheme0
Revision0
Head VersionHEAD
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • head
  • stable

パッケージグラフ

リンクは、ローカルのパッケージ関係グラフ、補足データ、依存関係、エコシステム一致、パッケージハブ所属から来ています。

関連ツール

  • openjdk@25Runtime dependency declared by Homebrew.
  • antBuild dependency declared by Homebrew.

同じワークフロー

  • mrbayesShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, mcmc, phylogenetics, science.
  • picard-toolsShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, java, science.
  • raxml-ngShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, phylogenetics, science.
  • pamlShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, phylogenetics, science.
  • fastmeShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, phylogenetics, science.
  • samtoolsShares pkgdb curated category or tags: bioinformatics, cli, science.

エージェント安全ガイド

ソース経路

リポジトリデータから生成

このページは scripts/generate-pkg-sqlite.py が生成した非公開のパッケージ SQLite アーティファクトから av-web によって提供されます。

使用ソース

  • Geiger risk classifier
  • cross-ecosystem install command graph
  • curated package history
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment
  • pkg.so package database
  • pkgdb category and tag curation