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Homebrewvérifié · 100%
brew install sylphlocal Homebrew formula metadata
brew / rang 14260
Installer sylph avec Homebrew
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de sylph pour les workflows d'agents IA.
installation
Commandes d'installation supplémentaires
aperçu
Résumé du paquet
Ultrafast taxonomic profiling and genome querying for metagenomic samples
Liens du projet
Commandes et alias
- sylph
historique
Historique du projet et usages
sylph is a Rust command-line tool for fast metagenomic profiling and containment average nucleotide identity querying from shotgun sequencing samples. It is packaged for scientists who want a small executable that can query or profile large genome databases quickly from the shell.
Historique du projet
The official documentation describes sylph as a program for metagenomic profiling and containment ANI querying. Its core method uses k-mer containment with a statistical technique for low-coverage genomes, and the documentation cites the 2024 Nature Biotechnology paper by Jim Shaw and Yun William Yu.
Historique d'adoption
The upstream README and documentation document installation through Bioconda, source builds with Rust/Cargo, and prebuilt x86-64 Linux binaries; the input package facts show Homebrew packaging as well. That mix reflects a bioinformatics CLI moving through both scientific package channels and general-purpose developer package managers.
Modes d'utilisation
Common usage is to run sylph profile against a prebuilt or custom database, such as GTDB, with paired-end or single-end FASTQ files, or to run ANI querying to test whether a sample contains a genome related to a queried reference. The docs emphasize fast multi-sample profiling, custom databases, prebuilt databases, and support for short or long reads.
Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent
Package nerds care because sylph is a modern scientific CLI distributed as a Rust binary: it needs reproducible installation, large external databases, predictable CPU/RAM behavior, and channels such as Bioconda and Homebrew to reach different user communities.
Chronologie
- 2024: Official documentation cites the sylph Nature Biotechnology paper by Jim Shaw and Yun William Yu.
- Current README era: The GitHub README says all documentation moved to sylph-docs.github.io.
- Homebrew packaging: The input package facts identify sylph as a Homebrew formula exposing the sylph executable.
Related projects
- Related tools and references named by the official docs include Kraken, MetaPhlAn, mOTUs, GTDB databases, Bioconda, Rust/Cargo, and sylph-tax.
Sources
- https://github.com/bluenote-1577/sylph
- https://github.com/bluenote-1577/sylph/blob/main/README.md
- https://sylph-docs.github.io/
- source_facts.executables
- source_facts.package-manager
posture de sécurité
Niveau de risque : vert
narrow executable package without higher-risk signals.
Classificateur de risque
risque vert · confiance faible · appliance
Pourquoi
- narrow executable package without higher-risk signals
Signaux
- metadata:no-higher-risk-signals
Comportement d'installation
- Aucune métadonnée de bottle Homebrew n’a été enregistrée.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
sylph | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fraîcheur
Version et fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
page générée2026-08-03
version du gestionnaire0.9.0
gestionnaire mis à jour
données localesinconnu
amontnon disponible
dernière version détectéenon détecté
- OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.
métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:sylph |
|---|---|
| Version | 0.9.0 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page d'accueil | https://github.com/bluenote-1577/sylph |
| Dépôt | https://github.com/bluenote-1577/sylph |
| Bouteille | non enregistré |
| Service | aucun déclaré |
piste source
Généré depuis les données du dépôt
Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Sources utilisées
- Geiger risk classifier
- cross-ecosystem install command graph
- curated package history
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation