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Homebrewvérifié · 100%
brew install nanoqprovider-native install command
brew / rang 19193
Installer nanoq avec Homebrew
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de nanoq pour les workflows d'agents IA.
installation
Commandes d'installation supplémentaires
aperçu
Résumé du paquet
Minimal but speedy quality control and summaries of nanopore reads
Liens du projet
Commandes et alias
- nanoq
historique
Historique du projet et usages
Nanoq is a Rust command-line utility for rapid filtering, trimming, quality control, and summary reporting of Oxford Nanopore FASTA/FASTQ reads. It is designed to work with files or Unix streams and emphasizes low memory use and high throughput.
Historique du projet
The public repository and first tagged releases appeared in March 2020. The project subsequently expanded its filters, reports, compression support, and machine-readable output, reaching the 0.8 series in 2021, 0.9.0 in 2022, and 0.10.0 in 2023. Steinig and Coin described Nanoq in the Journal of Open Source Software in 2022.
Historique d'adoption
Nanoq is distributed through Cargo, Conda/Bioconda, precompiled Linux and macOS release archives, and a Homebrew formula. Its official benchmarks position it alongside established sequencing utilities including NanoFilt, NanoStat, Filtlong, seqtk, SeqKit, and rust-bio-tools.
Modes d'utilisation
Users pass FASTA or FASTQ reads by file or standard input, apply length or quality filters and optional end trimming, and send surviving reads to a file or standard output. Statistics can be emitted as compact text, verbose summaries, or JSON; a fast mode skips quality-score calculation for greater throughput.
Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent
Nanoq is notable as a small, single-purpose Rust CLI that composes naturally in Unix pipelines while being packaged across the Rust, bioinformatics, binary-release, and Homebrew ecosystems. Its benchmarked trade-off between full quality calculations and an exceptionally fast quality-free mode makes it useful when choosing lightweight tools for large sequencing streams.
Chronologie
- 2020: First public tagged releases.
- 2021: The 0.8 release series broadened the mature CLI.
- 2022: Nanoq was published in the Journal of Open Source Software and version 0.9.0 was released.
- 2023: Version 0.10.0 was released.
Related projects
- NanoFilt and NanoStat provide nanopore filtering and statistics workflows used as official benchmark comparisons.
- Filtlong, seqtk, SeqKit, and rust-bio-tools are neighboring read-processing tools compared in Nanoq's official benchmarks.
- Needletail and niffler provide Nanoq's read-processing and compression foundations.
Sources
- https://github.com/esteinig/nanoq
- https://github.com/esteinig/nanoq/releases
- https://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.02991
- source_facts.package-manager.brew
posture de sécurité
Aucune couverture d'outil protégé trouvée pour le moment
Aucun manifest local de gestion des secrets correspondant n'a été trouvé pour nanoq. Les métadonnées de paquet Nucleus restent publiées ici afin que la couverture future dispose d'une URL stable.
Comportement d'installation
- Aucune métadonnée de bottle Homebrew n’a été enregistrée.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
nanoq | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fraîcheur
Version et fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
page générée2026-08-03
version du gestionnaire0.10.0
gestionnaire mis à jour2026-07-14
données localesinconnu
amontnon disponible
dernière version détectéenon détecté
- OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.
métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:nanoq |
|---|---|
| Version | 0.10.0 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page d'accueil | https://github.com/esteinig/nanoq |
| Dépôt | https://github.com/esteinig/nanoq |
| Dernière mise à jour | 2026-07-14T06:59:42Z |
| Pulse | updated |
| Bouteille | non enregistré |
| Service | aucun déclaré |
piste source
Généré depuis les données du dépôt
Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Sources utilisées
- Nucleus package database
- curated package history
- pkgdb category and tag curation