macOS
Homebrewvérifié · 100%
brew install mrbayeslocal Homebrew formula metadata
brew / rang 5125
Installer mrbayes avec Homebrew, apt, Nix, winget
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de mrbayes pour les workflows d'agents IA.
installation
Commandes d'installation supplémentaires
Linux
Debian aptvérifié · 92%
sudo apt install mrbayesDebian stable package indexes · mrbayes · Source: deb.debian.org
Nixvérifié · 92%
nix profile install nixpkgs#mrbayesnixpkgs package indexes · pkgs/by-name/mr/mrbayes/package.nix · Source: api.github.com
Windows
Windows Package Managervérifié · 92%
winget install --id NBIS.MrBayes -eWindows Package Manager source index · NBIS.MrBayes · Source: cdn.winget.microsoft.com
aperçu
Résumé du paquet
Bayesian inference of phylogenies and evolutionary models
Liens du projet
Commandes et alias
- mb
historique
Historique du projet et usages
MrBayes is a phylogenetics program for Bayesian inference and model choice across evolutionary models. John P. Huelsenbeck and Fredrik Ronquist introduced MRBAYES in Bioinformatics in 2001 as software for Bayesian inference of phylogeny using a variant of Markov chain Monte Carlo. The project later became associated with MrBayes 3, cited for Bayesian phylogenetic inference under mixed models, and MrBayes 3.2, cited for efficient inference and model selection across a large model space.
Historique du projet
The program's technical role is to make Bayesian phylogenetic analysis accessible through a command-line tool named mb. The official site lists support for nucleotide, amino-acid, restriction-site, and morphological data; mixed data types in one analysis; partitioned models with linked or unlinked parameters; many nucleotide and amino-acid rate matrices; clock trees; topology constraints; convergence diagnostics; stepping-stone model-likelihood estimation; MPI parallel jobs; BEAGLE acceleration; and checkpointing.
Modes d'utilisation
MrBayes is a research package more than a general developer tool. Its manual says new users are served by a manual with tutorials, model discussions, FAQ material, and differences between versions 2 and 3, while published analyses are expected to cite the relevant MrBayes papers and optional parallel or BEAGLE-method papers. The GitHub repository notes that after release 3.2.6 in November 2015 the project entered maintenance mode under the National Bioinformatics Infrastructure Sweden, with the original development team still involved and future work oriented mainly toward bug fixes. Package managers expose it as a command-line scientific application for reproducible phylogenetic workflows.
Sources
posture de sécurité
Niveau de risque : vert
narrow executable package without higher-risk signals.
Classificateur de risque
risque vert · confiance faible · appliance
Pourquoi
- narrow executable package without higher-risk signals
Signaux
- metadata:no-higher-risk-signals
Comportement d'installation
- Aucune métadonnée de bottle Homebrew n’a été enregistrée.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
mb | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fraîcheur
Version et fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
page générée2026-08-03
version du gestionnaire3.2.7a
gestionnaire mis à jour2026-07-29
données localesinconnu
amontnon disponible
dernière version détectéenon détecté
- OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.
métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:mrbayes |
|---|---|
| Version | 3.2.7a |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page d'accueil | https://nbisweden.github.io/MrBayes/ |
| Dépôt | https://github.com/NBISweden/MrBayes |
| Dernière mise à jour | 2026-07-29T14:13:07+09:00 |
| Pulse | updated |
| Bouteille | non enregistré |
| Service | aucun déclaré |
correspondances dans les bases sources
Autres enregistrements de gestionnaires de paquets
Les correspondances proviennent d’index externes de gestionnaires de paquets et restent séparées des liens de paquets Automic Vault locaux.
Debian apt95%
mrbayes 3.2.7a-7+b1
Bayesian Inference of Phylogeny
sudo apt install mrbayes- Section: science
- Architecture: amd64
- Source Package: mrbayes
- 3 Dépendances
- 1 dépendances optionnelles
- normalized package name match
- Correspondance par : Mrbayes
Debian apt95%
mrbayes-doc 3.2.7a-7
Bayesian Inference of Phylogeny - manual
sudo apt install mrbayes-doc- Section: doc
- Architecture: all
- Source Package: mrbayes
- normalized package name match
- Correspondance par : Mrbayes
Debian apt95%
mrbayes-mpi 3.2.7a-7+b1
Bayesian Inference of Phylogeny - mpi version
sudo apt install mrbayes-mpi- Section: science
- Architecture: amd64
- Source Package: mrbayes
- 5 Dépendances
- 2 dépendances optionnelles
- normalized package name match
- Correspondance par : Mrbayes
Nix95%
mrbayes
nix profile install nixpkgs#mrbayes- normalized package name match
- Correspondance par : Mrbayes
Ubuntu apt95%
mrbayes 3.2.7a-7build2
Bayesian Inference of Phylogeny
sudo apt install mrbayes- Section: universe/math
- Architecture: amd64
- 3 Dépendances
- 1 dépendances optionnelles
- normalized package name match
- Correspondance par : Mrbayes
Ubuntu apt95%
mrbayes-doc 3.2.7a-7build2
Bayesian Inference of Phylogeny - manual
sudo apt install mrbayes-doc- Section: universe/doc
- Architecture: all
- Source Package: mrbayes
- normalized package name match
- Correspondance par : Mrbayes
Ubuntu apt95%
mrbayes-mpi 3.2.7a-7build2
Bayesian Inference of Phylogeny - mpi version
sudo apt install mrbayes-mpi- Section: universe/science
- Architecture: amd64
- Source Package: mrbayes
- 5 Dépendances
- 2 dépendances optionnelles
- normalized package name match
- Correspondance par : Mrbayes
winget95%
NBIS.MrBayes
winget install --id NBIS.MrBayes -e- normalized package name match
- Correspondance par : Mrbayes
piste source
Généré depuis les données du dépôt
Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Sources utilisées
- Geiger risk classifier
- cross-ecosystem install command graph
- curated package history
- external package-manager database matches
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation