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brew install minibwalocal Homebrew formula metadata
brew / rang 10330
Installer minibwa avec Homebrew
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de minibwa pour les workflows d'agents IA.
installation
Commandes d'installation supplémentaires
aperçu
Résumé du paquet
Successor of BWA-MEM for short-read alignment
Liens du projet
Commandes et alias
- minibwa
historique
Historique du projet et usages
minibwa is a genomic read aligner from the BWA/minimap2 lineage. The repository identifies it as the successor of BWA-MEM for short-read alignment, and the arXiv preprint by Heng Li and Nils Homer presents it as a next iteration of BWA-MEM for standard whole-genome short reads, Hi-C reads, accurate long reads, and directional bisulfite sequencing data.
Historique du projet
The design deliberately mixes earlier tools by the same lineage: a BWA-MEM-style BWT/FM-index and variable-length seed search, ropebwt3-inspired supermaximal exact-match work, and minimap2-style chaining plus SIMD-based base alignment. The authors report comparable accuracy with much higher speed than BWA-MEM and BWA-MEM2, while noting that exact BWA-MEM compatibility is traded for algorithmic improvement.
Modes d'utilisation
In practice, minibwa is a bioinformatics command-line aligner for pipelines that map sequencing reads to a reference genome before variant calling, methylation analysis, or related downstream analysis. Its package-manager niche is narrow but important: it gives genomics users an installable replacement candidate for BWA-MEM where performance and support for newer read types matter more than byte-for-byte legacy output.
Sources
posture de sécurité
Aucune couverture d'outil protégé trouvée pour le moment
Aucun manifest local de gestion des secrets correspondant n'a été trouvé pour minibwa. Les métadonnées de paquet Nucleus restent publiées ici afin que la couverture future dispose d'une URL stable.
Comportement d'installation
- Aucune métadonnée de bottle Homebrew n’a été enregistrée.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
minibwa | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fraîcheur
Version et fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
page générée2026-08-03
version du gestionnaire0.6
gestionnaire mis à jour2026-07-30
données localesinconnu
amontnon disponible
dernière version détectéenon détecté
- OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.
métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:minibwa |
|---|---|
| Version | 0.6 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page d'accueil | https://github.com/lh3/minibwa |
| Dépôt | https://github.com/lh3/minibwa |
| Dernière mise à jour | 2026-07-30T15:48:22Z |
| Pulse | updated |
| Bouteille | non enregistré |
| Service | aucun déclaré |
piste source
Généré depuis les données du dépôt
Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Sources utilisées
- cross-ecosystem install command graph
- curated package history
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation