macOS
Homebrewvérifié · 100%
brew install dxpylocal Homebrew formula metadata
brew / rang 4498
Installer dxpy avec Homebrew
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de dxpy pour les workflows d'agents IA.
installation
Commandes d'installation supplémentaires
aperçu
Résumé du paquet
DNAnexus toolkit utilities and platform API bindings for Python
Liens du projet
Commandes et alias
- dx-app-wizard
- dx-build-app
- dx-build-applet
- dx-clone-asset
- dx-docker
- dx-download-all-inputs
- dx-fetch-bundled-depends
- dx-generate-dxapp
- dx-jobutil-add-output
- dx-jobutil-dxlink
- dx-jobutil-get-identity-token
- dx-jobutil-new-job
- dx-jobutil-parse-link
- dx-jobutil-report-error
- dx-log-stream
- dx-mount-all-inputs
- dx-notebook-reconnect
- dx-print-bash-vars
- dx-upload-all-outputs
historique
Historique du projet et usages
dxpy is the Python binding layer and command-line toolkit for the DNAnexus platform. The official Read the Docs page describes dxpy as Python bindings for interacting with the DNAnexus Platform API, both inside the DNAnexus execution environment and from external scripts.
Historique du projet
The official dx-toolkit git history begins with imported history in 2011 and early repository reorganization in March 2012. Official tags show v0.0.1 on 2012-08-09 and a long continuous release stream through v0.410.0 in June 2026.
Historique d'adoption
Unlike general-purpose Unix tools, dxpy adoption follows the DNAnexus platform itself: researchers and bioinformatics engineers use it to script platform objects, projects, files, apps, workflows, jobs, and API calls. The batch input exposes this as a Homebrew package with many dx-* executables rather than just a Python library.
Modes d'utilisation
The official docs organize dxpy around Pythonic bindings, low-level API wrappers, object handlers, projects, records, files, genomic tables, applets, apps, workflows, jobs, search, app building, utilities, and exceptions. In practice the packaged toolkit is used for DNAnexus login/configuration, data movement, applet/app development, job utilities, logging, Docker/Nextflow helper workflows, and scripted platform automation.
Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent
dxpy is significant as a packaged scientific-platform SDK: it turns a hosted genomics and biomedical analysis platform into reproducible shell and Python workflows. For package managers, it is a reminder that many science packages are not just libraries but operational CLIs with credentials, cloud objects, and platform-specific execution assumptions.
Chronologie
- 2011: Official git history begins with imported repository history.
- 2012: v0.0.1 tagged and DNAnexus Python docs carry 2012-2013 copyright.
- 2020: v0.300.0 tagged.
- 2023: v0.350.0 tagged.
- 2025: v0.400.0 tagged.
- 2026: v0.410.0 appears in the official changelog and tag list.
Related projects
- dxpy is part of DNAnexus dx-toolkit alongside the dx command family, DNAnexus API documentation, platform documentation, app builders, job utilities, Docker helpers, and Nextflow-related tooling referenced in recent changelog entries.
Sources
posture de sécurité
Aucune couverture d'outil protégé trouvée pour le moment
Aucun manifest local de gestion des secrets correspondant n'a été trouvé pour dxpy. Les métadonnées de paquet Nucleus restent publiées ici afin que la couverture future dispose d'une URL stable.
Comportement d'installation
- Aucune métadonnée de bottle Homebrew n’a été enregistrée.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
local files
Configuration and credential file locations
These source-backed paths show where this package keeps local settings or durable credentials. Automic Vault can use them as review targets for secret scanning, migration, and command approval.
Configuration files
Config paths the tool may read or write during local use.
- Unix
~/.dnanexus_config/environment.json
Credential files
Credential-bearing paths to review before unattended agent runs.
- Unix
~/.dnanexus_config/environment.json
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
dx-app-wizard | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-build-app | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-build-applet | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-clone-asset | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-docker | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-download-all-inputs | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-fetch-bundled-depends | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-generate-dxapp | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-jobutil-add-output | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-jobutil-dxlink | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-jobutil-get-identity-token | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-jobutil-new-job | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-jobutil-parse-link | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-jobutil-report-error | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-log-stream | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-mount-all-inputs | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-notebook-reconnect | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-print-bash-vars | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dx-upload-all-outputs | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fraîcheur
Version et fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
page générée2026-08-03
version du gestionnaire0.411.0
gestionnaire mis à jour2026-07-29
données localesinconnu
amontnon disponible
dernière version détectéenon détecté
- OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.
métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:dxpy |
|---|---|
| Version | 0.411.0 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page d'accueil | https://github.com/dnanexus/dx-toolkit |
| Dernière mise à jour | 2026-07-29T00:42:36Z |
| Pulse | updated |
| Bouteille | non enregistré |
| Service | aucun déclaré |
piste source
Généré depuis les données du dépôt
Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Sources utilisées
- Geiger risk classifier
- cross-ecosystem install command graph
- curated configuration and credential file locations
- curated package history
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation