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Homebrewvérifié · 100%
brew install btllibprovider-native install command
brew / rang 6276
Installer btllib avec Homebrew
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de btllib pour les workflows d'agents IA.
installation
Commandes d'installation supplémentaires
aperçu
Résumé du paquet
Bioinformatics Technology Lab common code library
Liens du projet
Commandes et alias
- indexlr
- mi_bf_generate
- randseq
historique
Historique du projet et usages
btllib is the Bioinformatics Technology Lab common code library, implemented in C++ with Python wrappers for genomic sequence processing. It packages reusable sequence I/O, hashing, Bloom-filter, and related components used by BTL/Birol Lab bioinformatics tools.
Historique du projet
The public git history starts in July 2019 with licensing, CI, and sequence-code commits. By 2020 the project had v1.0.0 tags, and it continued active releases through at least v1.7.8 in 2026.
The README presents btllib as a C++ library with Python wrappers, Linux and macOS support, Meson/Ninja builds, generated wrappers, Doxygen documentation, and generated executables installed under the package prefix.
Historique d'adoption
The README recommends Conda/Bioconda for users, while Homebrew, Debian, and Ubuntu packaging in the input show that btllib also entered general system package collections. Its JOSS publication in 2022 gave the project a citable software record for research use.
btllib is less a user-facing CLI than a packaged scientific dependency: package managers make its headers, static library, Python wrappers, and helper executables available to bioinformatics pipelines.
Modes d'utilisation
Developers link C++ code against libbtllib, include btllib headers, or import the generated Python wrappers. Runtime workflows can rely on external tools such as SAMtools and compression utilities, and btllib-generated executables are installed under the package prefix's bin directory.
Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent
btllib matters in package history because it is research infrastructure: a shared lab library that crossed from source builds into Bioconda, Homebrew, Debian, and Ubuntu, while carrying a formal software citation through JOSS.
Chronologie
- 2019: Public repository history starts with license, CI, and sequence-code setup.
- 2020: v1.0.0 appears in git history.
- 2022: JOSS publishes the btllib software paper.
- 2026: v1.7.8 appears in git history.
Related projects
- The README credits ntHash, MIBloomFilter, aaHash, cpptoml, and sdsl-lite components or dependencies.
- The README documents SAMtools and compression tools as runtime dependencies for particular file formats and workflows.
- Bioconda is the recommended user installation channel in the README.
Sources
- JOSS page records the 2022 paper 'btllib: A C++ library with Python interface for efficient genomic sequence processing': https://joss.theoj.org/papers/10.21105/joss.04720
- Local git history from https://github.com/bcgsc/btllib shows first commits in 2019, v1.0.0 in 2020, and v1.7.8 in 2026.
- Official README describes btllib as a Bioinformatics Technology Lab common code library in C++ with Python wrappers: https://raw.githubusercontent.com/bcgsc/btllib/master/README.md
- Official README documents Conda/Bioconda installation, C++ linking, Python wrappers, executables, developer commands, credits, and citation instructions: https://raw.githubusercontent.com/bcgsc/btllib/master/README.md
- Package-manager adoption from source_facts.package-manager.
posture de sécurité
Niveau de risque : vert
library-like package without higher-risk signals.
Classificateur de risque
risque vert · confiance faible · appliance
Pourquoi
- library-like package without higher-risk signals
Signaux
- metadata:library-like
Comportement d'installation
- Aucune métadonnée de bottle Homebrew n’a été enregistrée.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
indexlr | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mi_bf_generate | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
randseq | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fraîcheur
Version et fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
page générée2026-08-03
version du gestionnaire1.7.8
gestionnaire mis à jour2026-07-10
données localesinconnu
amontnon disponible
dernière version détectéenon détecté
- OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.
métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:btllib |
|---|---|
| Version | 1.7.8 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page d'accueil | https://github.com/BirolLab/btllib |
| Dépôt | https://github.com/BirolLab/btllib |
| Dernière mise à jour | 2026-07-10T16:33:06-04:00 |
| Pulse | updated |
| Bouteille | non enregistré |
| Service | aucun déclaré |
piste source
Généré depuis les données du dépôt
Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Sources utilisées
- Geiger risk classifier
- Nucleus package database
- curated package history
- pkgdb category and tag curation