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Homebrewvérifié · 100%
brew install bbtoolslocal Homebrew formula metadata
brew / rang 3734
Installer bbtools avec Homebrew
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de bbtools pour les workflows d'agents IA.
installation
Commandes d'installation supplémentaires
aperçu
Résumé du paquet
Brian Bushnell's tools for manipulating reads
Liens du projet
Commandes et alias
- a_sample_mt.sh
- addadapters.sh
- addssu.sh
- adjusthomopolymers.sh
- alignerbenchmark.sh
- alignrandom.sh
- alltoall.sh
- analyzeaccession.sh
- analyzegenes.sh
- analyzesketchresults.sh
- applyvariants.sh
- balancevectors.sh
- bamlinestreamer.sh
- bandedaligner.sh
- bandedplusaligner.sh
- bbcms.sh
- bbcountunique.sh
- bbcrisprfinder.sh
- bbduk.sh
- bbdukOld.sh
- bbdukS.sh
- bbest.sh
- bbfakereads.sh
- bbmap.sh
- bbmap5.sh
- bbmapacc.sh
- bbmapskimmer.sh
- bbmask.sh
- bbmerge-auto.sh
- bbmerge.sh
- bbnorm.sh
- bbrealign.sh
historique
Historique du projet et usages
BBTools is Brian Bushnell's large Java-based suite for DNA and RNA sequencing data. The suite includes BBMap, BBDuk, BBMerge, BBNorm, Tadpole, Clumpify, CallVariants, sketching tools, and many other command-line utilities.
Historique du projet
The official site identifies BBMap and BBTools as the official suite created and maintained by Brian Bushnell. The GitHub README describes BBTools as fast, multithreaded bioinformatics tools for common sequencing formats including FASTQ, FASTA, SAM/BAM, GFF/GTF, VCF, and compressed files.
The package grew from core read-mapping and read-processing utilities into a broad toolbox. The official site lists hundreds of tools, while the README highlights core workflows such as adapter trimming, read mapping, error correction, assembly, compression optimization, variant calling, and MinHash-style sketch comparison.
The upstream README lists the current version as 39.93 and states that BBTools is used in production at JGI and cited in thousands of publications.
Historique d'adoption
BBTools' adoption is anchored in genomics labs and sequencing pipelines rather than general developer workflows. Its official download paths include GitHub, SourceForge, and Docker, while Homebrew packages it for macOS and Linux users who want the command suite installed alongside other scientific CLI tools.
Modes d'utilisation
Common usage is pipeline-oriented: run scripts such as `bbduk.sh` for adapter trimming and quality filtering, `bbmap.sh` for short-read alignment, `bbmerge.sh` for paired-read merging, `tadpole.sh` for correction or small assembly, and `sendsketch.sh` for rapid organism identification.
Because it is Java-based and shell-script driven, BBTools is portable across Unix-like systems and easy to embed in HPC, workflow-manager, and lab automation environments.
Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent
BBTools matters to package nerds because it is a dense scientific tool suite distributed as many small executables from one upstream project. It is a good example of why package managers sometimes need to expose an entire research toolkit rather than one binary.
It also illustrates the packaging tension around bioinformatics software: users need reproducible versions, hundreds of entry points, Java runtime assumptions, documentation, and citation metadata, all for tools that may be critical to published scientific pipelines.
Chronologie
- 2014: README citation names `BBMap: A Fast, Accurate, Splice-Aware Aligner`.
- Current: Official README lists BBTools version 39.93.
- Current: Official website describes BBMap/BBTools as Brian Bushnell's maintained suite and links GitHub, SourceForge, and Docker distribution paths.
Related projects
- Related projects include BWA, Bowtie2, SAMtools, FastQC, Trimmomatic, Cutadapt, SPAdes, Kraken-style taxonomic tools, and other sequencing QC, alignment, assembly, and classification packages.
Sources
- https://bbmap.org/
- https://bbmap.org/tools
- https://github.com/bbushnell/BBTools#readme
- input:source_facts.executables
posture de sécurité
Aucune couverture d'outil protégé trouvée pour le moment
Aucun manifest local de gestion des secrets correspondant n'a été trouvé pour bbtools. Les métadonnées de paquet Nucleus restent publiées ici afin que la couverture future dispose d'une URL stable.
Comportement d'installation
- Aucune métadonnée de bottle Homebrew n’a été enregistrée.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
local files
Configuration and credential file locations
These source-backed paths show where this package keeps local settings or durable credentials. Automic Vault can use them as review targets for secret scanning, migration, and command approval.
Configuration files
Config paths the tool may read or write during local use.
- Unix
bbmap/config/
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
a_sample_mt.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
addadapters.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
addssu.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
adjusthomopolymers.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
alignerbenchmark.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
alignrandom.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
alltoall.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
analyzeaccession.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
analyzegenes.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
analyzesketchresults.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
applyvariants.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
balancevectors.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bamlinestreamer.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bandedaligner.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bandedplusaligner.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbcms.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbcountunique.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbcrisprfinder.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbduk.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbdukOld.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbdukS.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbest.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbfakereads.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbmap.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbmap5.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbmapacc.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbmapskimmer.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbmask.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbmerge-auto.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbmerge.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbnorm.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbrealign.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbrename.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbsketch.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbsort.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbsplit.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbsplitpairs.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbstats.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbversion.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bbwrap.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bedset.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bloomfilter.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
bloomfilterparser.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
calcmem.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
calctruequality.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
callgenes.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
callpeaks.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
callvariants.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
callvariants2.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
cat.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
cbcl2text.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
cg2illumina.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
checkstrand.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
cladeloader.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
cladeserver.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
cloudplot.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
clumpify.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
commonkmers.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
comparegff.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
comparelabels.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
comparesketch.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
comparessu.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
comparevcf.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
consect.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
consensus.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
copyfile.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
countbarcodes.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
countbarcodes2.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
countduplicates.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
countgc.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
countsharedlines.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
covmaker.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
crossblock.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
crosscontaminate.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
crosscutaligner.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
cutgff.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
cutprimers.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
ddlblacklist.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
ddlcalibrate.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
ddlcompare.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
ddlmerger.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
ddlwriter.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
decontaminate.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dedupe.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dedupe2.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dedupebymapping.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
demuxbyname.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
demuxserver.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
diskbench.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
dlctieraccuracy.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
driftingaligner.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
driftingplusaligner.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
estherfilter.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
explodetree.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fastqscan.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fetchproks.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filescan.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filterassemblysummary.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filterbarcodes.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filterbycoverage.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filterbyname.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filterbysequence.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filterbytaxa.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filterbytile.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filterlines.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filtersam.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filtersilva.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filtersubs.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
filtervcf.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
findrepeats.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
findssu.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fix_script_paths.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fixgaps.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fll2simulate.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fungalrelease.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fuse.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
fusebytaxa.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
gbff2gff.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
getreads.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
gi2ancestors.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
gi2taxid.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
gitable.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
glocalaligner.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
gradebins.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
grademerge.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
gradesam.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
gradevcf.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
icecreamfinder.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
icecreamgrader.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
icecreammaker.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
idmatrix.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
idtree.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
indelfree.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
invertkey.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
invertvcf.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
javasetup.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kapastats.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kcompress.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
keepbestcopy.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
khist.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmercountexact.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmercountmulti.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmercountshort.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmercoverage.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmerfilterset.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmerhashdump.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmerlimit.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmerlimit2.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmerposition.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
kmutate.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
lilypad.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
loadreads.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
loglog.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
lowcomplexcalibrate.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
makechimeras.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
makecontaminatedgenomes.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
makepolymers.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
makequickbinvector.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mantissacompare.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mapPacBio.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
matrixtocolumns.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
memdetect.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mergeOTUs.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mergebarcodes.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mergepgm.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mergeribo.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mergesam.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mergesam2.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mergesketch.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mergesorted.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
microalign.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
msa.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
mutate.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
muxbyname.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
netconvert.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
netfilter.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
novademux.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
parallelogram.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
partition.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
phylip2fasta.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
picksubset.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
pileup.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
pileup2.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
plotflowcell.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
plotgc.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
plothist.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
plotreadposition.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
polyfilter.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
postfilter.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
printtime.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
processfrag.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
processhi-c.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
processspeed.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
profile.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
quabblealigner.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
quantumaligner.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
quickbin.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
quickclade.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
randomgenome.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
randomreads.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
randomreadsmg.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
readlength.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
reassemble.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
reducecolumns.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
reducesilva.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
reformat.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
reformat2.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
reformat3.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
reformatpb.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
removebadbarcodes.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
removecatdogmousehuman.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
removehuman.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
removehuman2.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
removemicrobes.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
removesmartbell.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
rename.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
renamebymapping.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
renamebysketch.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
renameimg.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
renameref.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
repair.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
replaceheaders.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
representative.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
restorebases.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
rqcfilter.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
rqcfilter2.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
rqcfilter3.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
runhmm.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
samstreamer.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
samtoroc.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
scalarintervals.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
scalars.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
scoresequence.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
scrabblealigner.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
seal.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
sendclade.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
sendsketch.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
seqtovec.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
shred.sh | exécutable | exécutable indexé | Découvert depuis l'index local des exécutables. |
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dernière version détectéenon détecté
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métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:bbtools |
|---|---|
| Version | 40.01 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page d'accueil | https://bbmap.org/ |
| Dernière mise à jour | 2026-08-03T09:05:47Z |
| Pulse | updated |
| Bouteille | non enregistré |
| Service | aucun déclaré |
piste source
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Combined YAML source
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Sources utilisées
- Geiger risk classifier
- cross-ecosystem install command graph
- curated configuration and credential file locations
- curated package history
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation