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Homebrewvérifié · 100%
brew install rasusalocal Homebrew formula metadata
brew / rang 9805
Installer rasusa avec Homebrew
Consultez les chemins d'installation, exécutables, métadonnées et notes de sécurité de rasusa pour les workflows d'agents IA.
installation
Commandes d'installation supplémentaires
aperçu
Résumé du paquet
Randomly subsample sequencing reads or alignments
Liens du projet
Commandes et alias
- rasusa
historique
Historique du projet et usages
Rasusa is a Rust command-line program for randomly downsampling sequencing reads or genome alignments, including targeting a requested sequencing coverage.
Historique du projet
Rasusa was created to randomly subsample sequencing reads to a requested coverage. Its methods and purpose were documented in a 2022 Journal of Open Source Software paper. The project subsequently expanded beyond FASTQ reads to support unaligned and aligned SAM, BAM, and CRAM workflows, with alignment downsampling documented in a 2026 Gigabyte paper.
Historique d'adoption
Rasusa is available through precompiled release binaries, Cargo and cargo-binstall, Bioconda, containers, and Homebrew. The official README documents the shift of container distribution from Docker Hub to Quay.io and later to GitHub Container Registry.
Modes d'utilisation
For reads, users supply FASTQ or unaligned SAM/BAM/CRAM input and request a coverage or other sampling target; results are written to standard output unless otherwise directed. Current releases also provide alignment-oriented downsampling. The CLI supports paired sequencing data and integrates readily into shell and bioinformatics pipelines.
Pourquoi les passionnés de paquets s'y intéressent
Rasusa packages a common bioinformatics preprocessing task into a fast, reproducible Rust executable with few operational complications. Its presence across Cargo, Bioconda, containers, and Homebrew illustrates how research software can bridge language-native, scientific-workflow, and general-purpose package ecosystems.
Chronologie
- 2022: Rasusa was described in the Journal of Open Source Software.
- Before 0.4.0: Official containers were hosted on Docker Hub.
- 0.4.0–2.2.0: Official containers were hosted on Quay.io.
- 2026: Efficient genome-alignment downsampling with Rasusa was described in Gigabyte.
Related projects
- Cargo and cargo-binstall distribute the Rust executable.
- Bioconda integrates Rasusa into bioinformatics package and workflow environments.
- SAM, BAM, CRAM, and FASTQ are the principal sequencing formats handled by the tool.
Sources
posture de sécurité
Niveau de risque : vert
narrow executable package without higher-risk signals.
Classificateur de risque
risque vert · confiance faible · appliance
Pourquoi
- narrow executable package without higher-risk signals
Signaux
- metadata:no-higher-risk-signals
Comportement d'installation
- Aucun hook post-install Homebrew n’est enregistré dans les métadonnées de formule.
- Les métadonnées de bottle Homebrew sont disponibles pour 6 plateformes.
- Les métadonnées de compilation listent 1 dépendances de compilation.
Revue recommandée
Avant une utilisation sans surveillance par un agent, vérifiez si l'outil lit des identifiants en clair, écrit un état distant, publie des artefacts ou lance des plugins.
exécutables
Exécutables installés
| Commande | Type | Exposition | Note |
|---|---|---|---|
rasusa | cli | exécutable global |
fraîcheur
Version et fraîcheur
Ces signaux séparent l'âge de génération de la page, l'activité du gestionnaire de paquets et la comparaison avec les versions amont. Un retard de version n'est signalé que lorsqu'une URL de preuve et des versions comparables sont présentes.
page générée2026-09-19
version du gestionnaire5.1.0
gestionnaire mis à jour2026-09-13
données localesOK
amontà jour
dernière version détectée5.1.0
https://github.com/mbhall88/rasusa
- OKAucun avertissement de fraîcheur n'a été généré.
métadonnées d'installation
Métadonnées du paquet
| Clé du paquet | brew:rasusa |
|---|---|
| Version | 5.1.0 |
| Gestionnaire de paquets | Homebrew |
| Page du gestionnaire de paquets | https://formulae.brew.sh/formula/rasusa |
| Page d'accueil | https://doi.org/10.21105/joss.03941 |
| Dépôt | https://github.com/mbhall88/rasusa |
| Docs amont | https://doi.org/10.21105/joss.03941 |
| Licence | MIT |
| Archive source | https://github.com/mbhall88/rasusa/archive/refs/tags/5.1.0.tar.gz |
| Dernière mise à jour | 2026-09-13T07:18:51Z |
| Pulse | updated |
| Dépendances de compilation | rust |
| Bouteille | disponible (sur arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux) |
| post-install Homebrew | non défini |
| Service | aucun déclaré |
faits du registre
Détails de la base source
| Source Database | Homebrew formula API |
|---|---|
| Tap | homebrew/core |
| Full Name | rasusa |
| Version Scheme | 0 |
| Revision | 0 |
| Head Version | HEAD |
| Bottle Stable Root URL | https://ghcr.io/v2/homebrew/core |
| Deprecated | no |
| Disabled | no |
| Keg Only | no |
| URL Keys |
|
piste source
Généré depuis les données du dépôt
Cette page est servie par av-web depuis l'artéfact SQLite privé des paquets généré par scripts/generate-pkg-sqlite.py.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Sources utilisées
- Geiger risk classifier
- cross-ecosystem install command graph
- curated package history
- package relationship graph
- package version freshness
- package-page enrichment
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation