macOS
Homebrewverifiziert · 100%
brew install minibwaprovider-native install command
brew / Rang 10332
minibwa mit Homebrew installieren
Prüfe Installationswege, Executables, Metadaten und Sicherheitshinweise für minibwa in AI-Agent-Workflows.
Installation
Weitere Installationsbefehle
Überblick
Paketzusammenfassung
Successor of BWA-MEM for short-read alignment
Projektlinks
Befehle und Aliase
- minibwa
Verlauf
Projektgeschichte und Nutzung
minibwa is a genomic read aligner from the BWA/minimap2 lineage. The repository identifies it as the successor of BWA-MEM for short-read alignment, and the arXiv preprint by Heng Li and Nils Homer presents it as a next iteration of BWA-MEM for standard whole-genome short reads, Hi-C reads, accurate long reads, and directional bisulfite sequencing data.
Projektgeschichte
The design deliberately mixes earlier tools by the same lineage: a BWA-MEM-style BWT/FM-index and variable-length seed search, ropebwt3-inspired supermaximal exact-match work, and minimap2-style chaining plus SIMD-based base alignment. The authors report comparable accuracy with much higher speed than BWA-MEM and BWA-MEM2, while noting that exact BWA-MEM compatibility is traded for algorithmic improvement.
Wie es verwendet wird
In practice, minibwa is a bioinformatics command-line aligner for pipelines that map sequencing reads to a reference genome before variant calling, methylation analysis, or related downstream analysis. Its package-manager niche is narrow but important: it gives genomics users an installable replacement candidate for BWA-MEM where performance and support for newer read types matter more than byte-for-byte legacy output.
Quellen
Sicherheitslage
Noch keine Protected-Tool-Abdeckung gefunden
Für minibwa wurde kein passendes lokales Secret-Handling-Manifest gefunden. Nucleus-Paketmetadaten bleiben hier veröffentlicht, damit künftige Abdeckung eine stabile Paket-URL hat.
Installationsverhalten
- Es wurden keine Homebrew-Bottle-Metadaten erfasst.
Empfohlene Prüfung
Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.
Executables
Installierte Executables
| Befehl | Art | Sichtbarkeit | Hinweis |
|---|---|---|---|
minibwa | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
Aktualität
Version und Aktualität
Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.
Seite generiert2026-08-03
Manager-Version0.6
Manager aktualisiert2026-07-30
lokale Datenunbekannt
Upstreamnicht verfügbar
neueste erkannte Versionnicht erkannt
- OKEs wurden keine Aktualitätswarnungen generiert.
Installationsmetadaten
Paketmetadaten
| Paketschlüssel | brew:minibwa |
|---|---|
| Version | 0.6 |
| Paketmanager | Homebrew |
| Homepage | https://github.com/lh3/minibwa |
| Repository | https://github.com/lh3/minibwa |
| Zuletzt aktualisiert | 2026-07-30T15:48:22Z |
| Pulse | updated |
| Bottle | nicht erfasst |
| Dienst | keiner deklariert |
Quellspur
Aus Repository-Daten generiert
Diese Seite wird von av-web aus dem privaten Paket-SQLite-Artefakt bereitgestellt, das scripts/generate-pkg-sqlite.py erstellt.
Combined YAML source
View the package source record on GitHub.
Verwendete Quellen
- Nucleus package database
- curated package history
- pkgdb category and tag curation