pkg.soopen package index

brew / Rang 3040

diamond mit Homebrew, Nix installieren

Prüfe Installationswege, Executables, Metadaten und Sicherheitshinweise für diamond in AI-Agent-Workflows.

InstallationsbefehlSicherheitshinweise

Installation

Weitere Installationsbefehle

macOS

Homebrewverifiziert · 100%
brew install diamond

local Homebrew formula metadata

Linux

Nixverifiziert · 92%
nix profile install nixpkgs#diamond

nixpkgs package indexes · pkgs/by-name/di/diamond/package.nix · Quelle: api.github.com

Überblick

Paketzusammenfassung

Accelerated BLAST compatible local sequence aligner

Befehle und Aliase

  • diamond

Verlauf

Projektgeschichte und Nutzung

DIAMOND is a high-performance sequence aligner for protein and translated DNA searches, positioned as a BLAST-compatible tool for large biological datasets.

Projektgeschichte

The README says the initial version was developed by Benjamin J. Buchfink at the Huson lab, University of Tuebingen, from 2013 to 2015. Later development continued independently, with support from an EXIST grant in 2018-2019 and the Max Planck Institute for Biology Tuebingen from 2019 to 2024.

Adoptionsgeschichte

DIAMOND's adoption is tied to its promise of much faster BLAST-like protein and translated DNA alignment. The README highlights 100x to 10,000x BLAST speed, low resource requirements, downloads from GitHub releases, Bioconda availability, Galaxy integration, and citation badges.

Wie es verwendet wird

Package users install DIAMOND when they need command-line database creation, protein search, translated DNA search, sequence clustering, taxonomic classification, or BLAST-style tabular, pairwise, and XML outputs.

Warum Paket-Nerds sich dafür interessieren

DIAMOND is significant because it is a research-grade bioinformatics workhorse that also behaves like a normal packaged CLI. That combination makes it common in reproducible pipelines, containers, Conda environments, Homebrew installs, and HPC workflows.

Zeitleiste

  • 2013-2015: Initial version developed at the Huson lab, University of Tuebingen.
  • 2015: Original DIAMOND publication cited in the README.
  • 2021: Sensitive protein alignments at tree-of-life scale publication cited in the README.
  • 2026: v2.2.2 release published on GitHub.

Related projects

  • The README frames DIAMOND as BLAST-compatible and links it to Bioconda and the European Galaxy server for workflow use.

Sicherheitslage

Noch keine Protected-Tool-Abdeckung gefunden

Für diamond wurde kein passendes lokales Secret-Handling-Manifest gefunden. Nucleus-Paketmetadaten bleiben hier veröffentlicht, damit künftige Abdeckung eine stabile Paket-URL hat.

Installationsverhalten

  • Es wurden keine Homebrew-Bottle-Metadaten erfasst.

Empfohlene Prüfung

Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.

Executables

Installierte Executables

BefehlArtSichtbarkeitHinweis
diamondExecutableindexiertes ExecutableAus dem lokalen Executable-Index erkannt.

Aktualität

Version und Aktualität

Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.

Seite generiert2026-08-03
Manager-Version2.2.4
Manager aktualisiert2026-07-13
lokale Datenunbekannt
Upstreamnicht verfügbar
neueste erkannte Versionnicht erkannt
  • OKEs wurden keine Aktualitätswarnungen generiert.

Installationsmetadaten

Paketmetadaten

Paketschlüsselbrew:diamond
Version2.2.4
PaketmanagerHomebrew
Homepagehttps://github.com/bbuchfink/diamond
Repositoryhttps://github.com/bbuchfink/diamond
Zuletzt aktualisiert2026-07-13T15:30:35Z
Pulseupdated
Bottlenicht erfasst
Dienstkeiner deklariert

Source-Datenbank-Treffer

Andere Paketmanager-Einträge

Treffer stammen aus externen Paketmanager-Indizes und bleiben von lokalen Automic-Vault-Paketlinks getrennt.

Nix95%

diamond

nix profile install nixpkgs#diamond
  • normalized package name match
  • Abgeglichen nach: Diamond
nixpkgs package indexes · api.github.com · nixpkgs package indexes: pkgs/by-name/di/diamond/package.nix from https://api.github.com/repos/NixOS/nixpkgs/git/trees/master?recursive=1

Paketgraph

Links stammen aus dem lokalen Paketbeziehungsgraph, Ergänzungen, Abhängigkeitskanten, Ecosystem-Matches und Paket-Hub-Mitgliedschaft.

Quellspur

Aus Repository-Daten generiert

Diese Seite wird von av-web aus dem privaten Paket-SQLite-Artefakt bereitgestellt, das scripts/generate-pkg-sqlite.py erstellt.

Verwendete Quellen

  • Geiger risk classifier
  • cross-ecosystem install command graph
  • curated package history
  • external package-manager database matches
  • pkg.so package database
  • pkgdb category and tag curation