pkg.sopackage field notes

brew / Rang 6011

beast mit Homebrew installieren

Prüfe Installationswege, Executables, Metadaten und Sicherheitshinweise für beast in AI-Agent-Workflows.

Installation

Weitere Installationsbefehle

macOS

Homebrewverifiziert · 100%
brew install beast

provider-native install command

Überblick

Paketzusammenfassung

Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees

Befehle und Aliase

  • beast
  • beauti
  • loganalyser
  • logcombiner
  • treeannotator
  • treestat

Verlauf

Projektgeschichte und Nutzung

BEAST is Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees, a scientific software package for Bayesian phylogenetic analysis of molecular sequences using MCMC.

Projektgeschichte

The official documentation describes BEAST as focused on rooted, time-measured phylogenies, strict or relaxed molecular-clock models, coalescent population models, and Bayesian model testing.

The official About page credits Alexei J. Drummond, Andrew Rambaut, and Marc A. Suchard as designers and developers, with a large contributor and institutional-support history across evolutionary-analysis research.

Adoptionsgeschichte

BEAST's adoption is primarily academic and scientific rather than general developer tooling. The official README distributes binaries for Mac, Windows, and UNIX/Linux and the Homebrew package exposes the command-line programs for Unix package users.

The supplied Homebrew metadata includes executables such as beast, beauti, loganalyser, logcombiner, treeannotator, and treestat, reflecting the suite-style workflow used to set up analyses, run MCMC, and inspect results.

Wie es verwendet wird

Typical BEAST workflows use BEAUti to prepare XML analysis files, beast to run Bayesian MCMC analyses, and companion tools such as LogAnalyser, LogCombiner, TreeAnnotator, and TreeStat to inspect or summarize outputs.

The package is Java-based and cross-platform, but the Homebrew formula makes its command-line tools available in the same way as other scientific CLI suites.

Warum Paket-Nerds sich dafür interessieren

BEAST is significant as a package because it brings a full research-grade phylogenetics suite into package-manager workflows. It is not a small Unix filter, but Homebrew makes the JVM-backed analysis tools installable and scriptable beside other scientific software.

Zeitleiste

  • 2015: The official GitHub repository for beast-mcmc was created.
  • 2016: The GitHub releases include BEAST v1.8.4.
  • 2018: The GitHub releases include BEAST v1.10.4, identified by the README as the previous major release.
  • 2025: The GitHub releases include BEAST X v10.5.0.
  • 2026: The official site and repository continue to describe BEAST X and recent beta releases.

Related projects

  • BEAUti, LogAnalyser, LogCombiner, TreeAnnotator, and TreeStat are bundled companion programs in the BEAST workflow.
  • BEAST 2 is a related project in the broader BEAST ecosystem, but this Homebrew package points at the beast-mcmc repository and BEAST X documentation.

Sicherheitslage

Noch keine Protected-Tool-Abdeckung gefunden

Für beast wurde kein passendes lokales Secret-Handling-Manifest gefunden. Nucleus-Paketmetadaten bleiben hier veröffentlicht, damit künftige Abdeckung eine stabile Paket-URL hat.

Installationsverhalten

  • Es wurden keine Homebrew-Bottle-Metadaten erfasst.

Empfohlene Prüfung

Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.

Executables

Installierte Executables

BefehlArtSichtbarkeitHinweis
beastExecutableindexiertes ExecutableAus dem lokalen Executable-Index erkannt.
beautiExecutableindexiertes ExecutableAus dem lokalen Executable-Index erkannt.
loganalyserExecutableindexiertes ExecutableAus dem lokalen Executable-Index erkannt.
logcombinerExecutableindexiertes ExecutableAus dem lokalen Executable-Index erkannt.
treeannotatorExecutableindexiertes ExecutableAus dem lokalen Executable-Index erkannt.
treestatExecutableindexiertes ExecutableAus dem lokalen Executable-Index erkannt.

Aktualität

Version und Aktualität

Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.

Seite generiert2026-08-03
Manager-Version10.5.0
Manager aktualisiert2026-05-20
lokale Datenunbekannt
Upstreamnicht verfügbar
neueste erkannte Versionnicht erkannt
  • OKEs wurden keine Aktualitätswarnungen generiert.

Installationsmetadaten

Paketmetadaten

Paketschlüsselbrew:beast
Version10.5.0
PaketmanagerHomebrew
Homepagehttps://beast.community/
Repositoryhttps://github.com/beast-dev/beast-mcmc
Zuletzt aktualisiert2026-05-20T10:15:39Z
Pulseupdated
Bottlenicht erfasst
Dienstkeiner deklariert

Quellspur

Aus Repository-Daten generiert

Diese Seite wird von av-web aus dem privaten Paket-SQLite-Artefakt bereitgestellt, das scripts/generate-pkg-sqlite.py erstellt.

Verwendete Quellen

  • Geiger risk classifier
  • Nucleus package database
  • curated package history
  • pkgdb category and tag curation