macOS
Homebrewverifiziert · 100%
brew install bbtoolslocal Homebrew formula metadata
brew / Rang 3734
bbtools mit Homebrew installieren
Prüfe Installationswege, Executables, Metadaten und Sicherheitshinweise für bbtools in AI-Agent-Workflows.
Installation
Weitere Installationsbefehle
Überblick
Paketzusammenfassung
Brian Bushnell's tools for manipulating reads
Projektlinks
Befehle und Aliase
- a_sample_mt.sh
- addadapters.sh
- addssu.sh
- adjusthomopolymers.sh
- alignerbenchmark.sh
- alignrandom.sh
- alltoall.sh
- analyzeaccession.sh
- analyzegenes.sh
- analyzesketchresults.sh
- applyvariants.sh
- balancevectors.sh
- bamlinestreamer.sh
- bandedaligner.sh
- bandedplusaligner.sh
- bbcms.sh
- bbcountunique.sh
- bbcrisprfinder.sh
- bbduk.sh
- bbdukOld.sh
- bbdukS.sh
- bbest.sh
- bbfakereads.sh
- bbmap.sh
- bbmap5.sh
- bbmapacc.sh
- bbmapskimmer.sh
- bbmask.sh
- bbmerge-auto.sh
- bbmerge.sh
- bbnorm.sh
- bbrealign.sh
Verlauf
Projektgeschichte und Nutzung
BBTools is Brian Bushnell's large Java-based suite for DNA and RNA sequencing data. The suite includes BBMap, BBDuk, BBMerge, BBNorm, Tadpole, Clumpify, CallVariants, sketching tools, and many other command-line utilities.
Projektgeschichte
The official site identifies BBMap and BBTools as the official suite created and maintained by Brian Bushnell. The GitHub README describes BBTools as fast, multithreaded bioinformatics tools for common sequencing formats including FASTQ, FASTA, SAM/BAM, GFF/GTF, VCF, and compressed files.
The package grew from core read-mapping and read-processing utilities into a broad toolbox. The official site lists hundreds of tools, while the README highlights core workflows such as adapter trimming, read mapping, error correction, assembly, compression optimization, variant calling, and MinHash-style sketch comparison.
The upstream README lists the current version as 39.93 and states that BBTools is used in production at JGI and cited in thousands of publications.
Adoptionsgeschichte
BBTools' adoption is anchored in genomics labs and sequencing pipelines rather than general developer workflows. Its official download paths include GitHub, SourceForge, and Docker, while Homebrew packages it for macOS and Linux users who want the command suite installed alongside other scientific CLI tools.
Wie es verwendet wird
Common usage is pipeline-oriented: run scripts such as `bbduk.sh` for adapter trimming and quality filtering, `bbmap.sh` for short-read alignment, `bbmerge.sh` for paired-read merging, `tadpole.sh` for correction or small assembly, and `sendsketch.sh` for rapid organism identification.
Because it is Java-based and shell-script driven, BBTools is portable across Unix-like systems and easy to embed in HPC, workflow-manager, and lab automation environments.
Warum Paket-Nerds sich dafür interessieren
BBTools matters to package nerds because it is a dense scientific tool suite distributed as many small executables from one upstream project. It is a good example of why package managers sometimes need to expose an entire research toolkit rather than one binary.
It also illustrates the packaging tension around bioinformatics software: users need reproducible versions, hundreds of entry points, Java runtime assumptions, documentation, and citation metadata, all for tools that may be critical to published scientific pipelines.
Zeitleiste
- 2014: README citation names `BBMap: A Fast, Accurate, Splice-Aware Aligner`.
- Current: Official README lists BBTools version 39.93.
- Current: Official website describes BBMap/BBTools as Brian Bushnell's maintained suite and links GitHub, SourceForge, and Docker distribution paths.
Related projects
- Related projects include BWA, Bowtie2, SAMtools, FastQC, Trimmomatic, Cutadapt, SPAdes, Kraken-style taxonomic tools, and other sequencing QC, alignment, assembly, and classification packages.
Quellen
- https://bbmap.org/
- https://bbmap.org/tools
- https://github.com/bbushnell/BBTools#readme
- input:source_facts.executables
Sicherheitslage
Noch keine Protected-Tool-Abdeckung gefunden
Für bbtools wurde kein passendes lokales Secret-Handling-Manifest gefunden. Nucleus-Paketmetadaten bleiben hier veröffentlicht, damit künftige Abdeckung eine stabile Paket-URL hat.
Installationsverhalten
- Es wurden keine Homebrew-Bottle-Metadaten erfasst.
Empfohlene Prüfung
Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.
local files
Configuration and credential file locations
These source-backed paths show where this package keeps local settings or durable credentials. Automic Vault can use them as review targets for secret scanning, migration, and command approval.
Configuration files
Config paths the tool may read or write during local use.
- Unix
bbmap/config/
Executables
Installierte Executables
| Befehl | Art | Sichtbarkeit | Hinweis |
|---|---|---|---|
a_sample_mt.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
addadapters.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
addssu.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
adjusthomopolymers.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
alignerbenchmark.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
alignrandom.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
alltoall.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
analyzeaccession.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
analyzegenes.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
analyzesketchresults.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
applyvariants.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
balancevectors.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bamlinestreamer.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bandedaligner.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bandedplusaligner.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbcms.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbcountunique.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbcrisprfinder.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbduk.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbdukOld.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbdukS.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbest.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbfakereads.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbmap.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbmap5.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbmapacc.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbmapskimmer.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbmask.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbmerge-auto.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbmerge.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbnorm.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbrealign.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbrename.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbsketch.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbsort.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbsplit.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbsplitpairs.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbstats.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbversion.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bbwrap.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bedset.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bloomfilter.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
bloomfilterparser.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
calcmem.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
calctruequality.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
callgenes.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
callpeaks.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
callvariants.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
callvariants2.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
cat.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
cbcl2text.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
cg2illumina.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
checkstrand.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
cladeloader.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
cladeserver.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
cloudplot.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
clumpify.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
commonkmers.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
comparegff.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
comparelabels.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
comparesketch.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
comparessu.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
comparevcf.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
consect.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
consensus.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
copyfile.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
countbarcodes.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
countbarcodes2.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
countduplicates.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
countgc.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
countsharedlines.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
covmaker.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
crossblock.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
crosscontaminate.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
crosscutaligner.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
cutgff.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
cutprimers.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
ddlblacklist.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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ddlmerger.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
ddlwriter.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
decontaminate.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
dedupe.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
dedupe2.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
dedupebymapping.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
demuxbyname.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
demuxserver.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
diskbench.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
dlctieraccuracy.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
driftingaligner.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
driftingplusaligner.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
estherfilter.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
explodetree.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
fastqscan.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
fetchproks.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
filescan.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
filterassemblysummary.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
filterbarcodes.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
filterbycoverage.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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filterbysequence.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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filterbytile.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
filterlines.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
filtersam.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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filtervcf.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
findrepeats.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
findssu.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
fix_script_paths.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
fixgaps.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
fll2simulate.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
fungalrelease.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
fuse.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
fusebytaxa.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
gbff2gff.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
getreads.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
gi2ancestors.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
gi2taxid.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
gitable.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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grademerge.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
gradesam.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
gradevcf.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
icecreamfinder.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
icecreamgrader.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
icecreammaker.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
idmatrix.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
idtree.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
indelfree.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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invertvcf.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
javasetup.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
kapastats.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
kcompress.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
keepbestcopy.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
khist.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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kmercountmulti.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
kmercountshort.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
kmercoverage.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
kmerfilterset.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
kmerhashdump.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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loadreads.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
loglog.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
lowcomplexcalibrate.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
makechimeras.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
makecontaminatedgenomes.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
makepolymers.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
makequickbinvector.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
mantissacompare.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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netfilter.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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partition.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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picksubset.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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plothist.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
plotreadposition.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
polyfilter.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
postfilter.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
printtime.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
processfrag.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
processhi-c.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
processspeed.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
profile.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
quabblealigner.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
quantumaligner.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
quickbin.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
quickclade.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
randomgenome.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
randomreads.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
randomreadsmg.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
readlength.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
reassemble.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
reducecolumns.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
reducesilva.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
reformat.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
reformat2.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
reformat3.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
reformatpb.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
removebadbarcodes.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
removecatdogmousehuman.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
removehuman.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
removehuman2.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
removemicrobes.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
removesmartbell.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
rename.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
renamebymapping.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
renamebysketch.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
renameimg.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
renameref.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
repair.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
replaceheaders.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
representative.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
restorebases.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
rqcfilter.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
rqcfilter2.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
rqcfilter3.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
runhmm.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
samstreamer.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
samtoroc.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
scalarintervals.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
scalars.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
scoresequence.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
scrabblealigner.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
seal.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
sendclade.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
sendsketch.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
seqtovec.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
shred.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
shrinkaccession.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
shuffle.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
shuffle2.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
sketch.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
sketchblacklist.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
sketchblacklist2.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
smithwaterman.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
sortbyname.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
splitbytaxa.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
splitnextera.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
splitribo.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
splitsam.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
splitsam4way.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
splitsam6way.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
ssuserver.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
stats.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
stats3.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
statswrapper.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
stream.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
streamsam.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
subsketch.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
summarizecontam.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
summarizecoverage.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
summarizecrossblock.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
summarizemerge.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
summarizequast.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
summarizescafstats.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
summarizeseal.sh | Executable | indexiertes Executable | Aus dem lokalen Executable-Index erkannt. |
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Aktualität
Version und Aktualität
Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.
Seite generiert2026-08-03
Manager-Version40.01
Manager aktualisiert2026-08-03
lokale Datenunbekannt
Upstreamnicht verfügbar
neueste erkannte Versionnicht erkannt
- OKEs wurden keine Aktualitätswarnungen generiert.
Installationsmetadaten
Paketmetadaten
| Paketschlüssel | brew:bbtools |
|---|---|
| Version | 40.01 |
| Paketmanager | Homebrew |
| Homepage | https://bbmap.org/ |
| Zuletzt aktualisiert | 2026-08-03T09:05:47Z |
| Pulse | updated |
| Bottle | nicht erfasst |
| Dienst | keiner deklariert |
Quellspur
Aus Repository-Daten generiert
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Combined YAML source
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Verwendete Quellen
- Geiger risk classifier
- cross-ecosystem install command graph
- curated configuration and credential file locations
- curated package history
- pkg.so package database
- pkgdb category and tag curation