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brew / Rang 10313

minibwa mit Homebrew installieren

Prüfe Installationswege, Executables, Metadaten und Sicherheitshinweise für minibwa in AI-Agent-Workflows.

Installation

Weitere Installationsbefehle

macOS

Homebrewverifiziert · 100%
brew install minibwa

local Homebrew formula metadata

Überblick

Paketzusammenfassung

Successor of BWA-MEM for short-read alignment

Befehle und Aliase

  • minibwa

Verlauf

Projektgeschichte und Nutzung

minibwa is a genomic read aligner from the BWA/minimap2 lineage. The repository identifies it as the successor of BWA-MEM for short-read alignment, and the arXiv preprint by Heng Li and Nils Homer presents it as a next iteration of BWA-MEM for standard whole-genome short reads, Hi-C reads, accurate long reads, and directional bisulfite sequencing data.

Projektgeschichte

The design deliberately mixes earlier tools by the same lineage: a BWA-MEM-style BWT/FM-index and variable-length seed search, ropebwt3-inspired supermaximal exact-match work, and minimap2-style chaining plus SIMD-based base alignment. The authors report comparable accuracy with much higher speed than BWA-MEM and BWA-MEM2, while noting that exact BWA-MEM compatibility is traded for algorithmic improvement.

Wie es verwendet wird

In practice, minibwa is a bioinformatics command-line aligner for pipelines that map sequencing reads to a reference genome before variant calling, methylation analysis, or related downstream analysis. Its package-manager niche is narrow but important: it gives genomics users an installable replacement candidate for BWA-MEM where performance and support for newer read types matter more than byte-for-byte legacy output.

Sicherheitslage

Noch keine Protected-Tool-Abdeckung gefunden

Für minibwa wurde kein passendes lokales Secret-Handling-Manifest gefunden. Paketmetadaten bleiben hier veröffentlicht, damit künftige Abdeckung eine stabile Paket-URL hat.

Installationsverhalten

  • In den Formelmetadaten ist kein Homebrew-Post-install-Hook erfasst.
  • Homebrew-Bottle-Metadaten sind für 6 Plattformziele verfügbar.

Empfohlene Prüfung

Prüfe vor unbeaufsichtigter Agent-Nutzung, ob das Tool Klartext-Credentials liest, Remote-Zustand schreibt, Artefakte veröffentlicht oder Plugins ausführt.

Executables

Installierte Executables

BefehlArtSichtbarkeitHinweis
minibwacliglobales Executable

Aktualität

Version und Aktualität

Diese Signale trennen das Alter der Seitengenerierung, Aktivität des Paketmanagers und Upstream-Release-Vergleich. Versionsrückstand wird nur gemeldet, wenn eine Evidenz-URL und vergleichbare Versionen vorhanden sind.

Seite generiert2026-08-04
Manager-Version0.6
Manager aktualisiert2026-07-30
lokale DatenOK
Upstreamaktuell
neueste erkannte Versionv0.6

https://github.com/lh3/minibwa

  • OKEs wurden keine Aktualitätswarnungen generiert.

Installationsmetadaten

Paketmetadaten

Paketschlüsselbrew:minibwa
Version0.6
PaketmanagerHomebrew
Paketmanager-Seitehttps://formulae.brew.sh/formula/minibwa
Homepagehttps://github.com/lh3/minibwa
Repositoryhttps://github.com/lh3/minibwa
LizenzMIT AND Apache-2.0
Quellarchivhttps://github.com/lh3/minibwa/archive/refs/tags/v0.6.tar.gz
Zuletzt aktualisiert2026-07-30T15:48:22Z
Pulseupdated
Bottleverfügbar (auf arm64_linux, arm64_sequoia, arm64_sonoma, arm64_tahoe, sonoma, x86_64_linux)
Homebrew post-installnicht definiert
Dienstkeiner deklariert

Registry-Fakten

Details aus der Quelldatenbank

Source DatabaseHomebrew formula API
Taphomebrew/core
Full Nameminibwa
Version Scheme0
Revision0
Bottle Stable Root URLhttps://ghcr.io/v2/homebrew/core
Deprecatedno
Disabledno
Keg Onlyno
URL Keys
  • stable

Quellspur

Aus Repository-Daten generiert

Diese Seite wird von av-web aus dem privaten Paket-SQLite-Artefakt bereitgestellt, das scripts/generate-pkg-sqlite.py erstellt.

Verwendete Quellen

  • cross-ecosystem install command graph
  • curated package history
  • package relationship graph
  • package version freshness
  • package-page enrichment
  • pkg.so package database
  • pkgdb category and tag curation